專家共識(shí)丨《前列腺癌同源重組修復(fù)基因檢測及變異解讀專家共識(shí)》-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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專家共識(shí)丨《前列腺癌同源重組修復(fù)基因檢測及變異解讀專家共識(shí)》

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2022-12-28T11:34 (訪問量:14897)

同源重組(HRR)是高度保真的DNA雙鏈斷裂(DSB)的修復(fù)方式。

在前列腺中,同源重組修復(fù)(HRR)基因突變的發(fā)生頻率約 14.1%,主要突變基因?yàn)锽RCA2、ATM、BRCA1和CHEK2。


HRR基因突變與前列腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)、預(yù)后及PARP抑制劑治療療效相關(guān)。

前列腺癌臨床實(shí)踐NCCN指南2022.v4版中推薦所有轉(zhuǎn)移性前列腺癌患者進(jìn)行腫瘤樣本HRR基因突變檢測以指導(dǎo)治療;對于有腫瘤家族史或高風(fēng)險(xiǎn)胚系突變(如BRCA1/2)家族史、局限期高危和極高危、局部晚期、轉(zhuǎn)移性患者進(jìn)行胚系 HRR 基因和 DNA 錯(cuò)配修復(fù)基因檢測。

對于 HRR 基因檢測適用人群,按照不同的檢測目的,專家共識(shí)中分別作出推薦。

以評估遺傳風(fēng)險(xiǎn)為目的時(shí):

  • 推薦對高危、極高危、局部晚期、轉(zhuǎn)移性前列腺癌患者進(jìn)行胚系突變檢測(Ⅰ級推薦);

  • 推薦對具有特定腫瘤家族史、乳腺癌病史或家系已知 HRR 基因致病/可能致病性變異的極低危、低危、中危前列腺癌患者進(jìn)行胚系突變檢測(Ⅰ級推薦);

  • 推薦對具有胰腺癌、黑色素瘤、結(jié)直腸癌、胃癌、膽管癌、小腸癌、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤或上尿路尿路上皮癌病史的極低危、低危、中危前列腺癌患者進(jìn)行胚系突變檢測(Ⅱ級推薦);

  • 推薦對具有導(dǎo)管內(nèi)癌或?qū)Ч芟侔┏煞值那傲邢侔┗颊哌M(jìn)行胚系突變檢測(Ⅱ級推薦)。

  • 建議在胚系突變檢測前后對患者進(jìn)行遺傳咨詢。

  • 檢測基因至少包括:BRCA1、BRCA2、ATM、PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2。

以制定治療決策為目的時(shí):

  • 推薦對轉(zhuǎn)移性去勢抵抗前列腺癌患者進(jìn)行腫瘤檢測(Ⅰ級推薦);

  • 推薦對轉(zhuǎn)移性去勢敏感前列腺癌患者進(jìn)行腫瘤檢測(Ⅱ級推薦);

  • 推薦對局部晚期前列腺癌患者進(jìn)行腫瘤檢測(Ⅲ級推薦)。

檢測的HRR基因至少包括:BRCA1、BRCA2、ATM、BARD1、BRIP1、CDK12、CHEK1、 CHEK2、 FANCL、 PALB2、 RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L。

HRR通路涉及多個(gè)基因,且HRR基因缺乏熱點(diǎn)突變,因而HRR基因突變檢測一般采用NGS技術(shù) 。

由于目前我國國家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)尚未批準(zhǔn)相關(guān)伴隨診斷試劑盒,所以HRR基因檢測需要采用經(jīng)過充分性能驗(yàn)證(包括精準(zhǔn)性、準(zhǔn)確性、分析靈敏度、分析特異度、穩(wěn)定性、檢測范圍等)的檢測方法;檢測基因需至少覆蓋藥監(jiān)部門批準(zhǔn)和指南共識(shí)中推薦的HRR基因;探針設(shè)計(jì)需覆蓋這些基因的全部外顯子區(qū)域,以及與外顯子交界的內(nèi)含子區(qū)域(外顯子上下游±20 bp);檢測變異類型需覆蓋單核苷酸變異、小片段插入缺失、拷貝數(shù)變異等。

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菁良HRR質(zhì)控品解決方案

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菁良基因HRR質(zhì)控品包含與HRR通路相關(guān)的基因突變,可定制gDNA,ctDNA或者FFPE等產(chǎn)品形式,是HRR檢測試劑盒注冊報(bào)證及HRR檢測日常質(zhì)控理想的參考品。

產(chǎn)品特點(diǎn)

  • 細(xì)胞系來源:更接近臨床樣本

  • 覆蓋HRR通路大部分基因:>24 個(gè)HRR相關(guān)基因,>170 個(gè)突變位點(diǎn)

  • 可定制Pathogenic、likely Pathogenic, VUS, likely benign, benign多種臨床意義的突變位點(diǎn)

  • 靈活的定制方案:可混合特定的突變位點(diǎn),及選擇對應(yīng)突變頻率至一個(gè)產(chǎn)品

  • 突變頻率可定制范圍廣:0%-100%

  • 多種產(chǎn)品形式可選:gDNA、ctDNA、FFPE

  • 位點(diǎn)經(jīng)ddPCR驗(yàn)證:絕對定量AF

  • 質(zhì)量認(rèn)證:ISO9001

可定制HRR相關(guān)通路基因突變:

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BRCA1, BRCA2, ATM, ATR, BARD1, BLM, BRIP1, CDK12, CHEK1, CHEK2, FANCA, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCI, FANCL, FANCM, NBN, PALB2, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51D, RAD54L, RPA1...

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參考資料:

[1]中華醫(yī)學(xué)會(huì)病理學(xué)分會(huì),中華醫(yī)學(xué)會(huì)泌尿外科學(xué)分會(huì),國家病理質(zhì)控中心.前列腺癌同源重組修復(fù)基因檢測及變異解讀專家共識(shí)[J].中華病理學(xué)雜志,2022,51(10):941-949.

[2]Heeke A L ,? Pishvaian M J ,? Lynce F , et al. Prevalence of Homologous Recombination–Related Gene Mutations Across Multiple Cancer Types[J]. JCO Precision Oncology, 2018, 2018(2):1-13.

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