菁良基因ctDNA套裝標準品即將上市！
近日，菁良基因肺癌ctDNA套裝即將上市，為方便更多客戶選擇，菁良基因通過結合《液體活檢在臨床腫瘤診療應用和醫(yī)學檢驗實踐中的專家共識》與ctDNA標準品，針對監(jiān)測流程的優(yōu)化驗證及質(zhì)量管理，總結出解決方案。
共識要點如下：?
一、液體活檢中的腫瘤循環(huán)DNA檢測介紹
目前，實驗室常用的ctDNA 檢測技術包括擴增受阻突變體系（amplification refractory mutation system, ARMS）、二代測序（next-generation sequencing,NGS）、數(shù)字PCR（digital PCR,dPCR）和核酸質(zhì)譜檢測等。ARMS方法是目前獲得中國食品藥品監(jiān)督管理局 （China Food and Drug Administration，CFDA）批準可用于臨床 ctDNA 檢測的方法，在臨床實踐中應用相對普及。
專家組認為檢測已知、單個靶向治療敏感或耐藥型突變時，建議使用 ARMS 方法；檢測已知、多個平行臨床治療靶點或發(fā)現(xiàn)未知基因、探索臨床價值與相關機制時建議使用NGS方法；dPCR具有驗證NGS檢測結果的潛能，但在應用前應當嚴格評估其檢測性能與臨床意義。
二、液體活檢的應用范圍
1. 腫瘤早期輔助診斷
2. 指導臨床用藥
腫瘤相關基因改變與靶向藥物選擇
3. 靶向藥物伴隨診斷
常見適用伴隨診斷的藥物及其靶點
4. 實時療效監(jiān)測
5. 腫瘤進展與不良預后早期預警
6. 耐藥機制探索
三、活檢技術的優(yōu)化和驗證
1. 基于PCR方法(包括 ARMS 和 dPCR) ctDNA 檢測體系的性能驗證
- 特異性
- 敏感度
- 測定下限
- 重復性
- 準確性
- 抗干擾能力
2. 基于 NGS 方法 ctDNA 檢測體系的性能確認
- 陽性預期值(Positive Predictive Value， PPV)
- 陽性百分比一致性
- 重復性
- 可報告范圍/參考范圍
- 最低檢出限
- 抗干擾性能
- 臨床有效性
- 生信分析流程
四、質(zhì)量管理
實驗室質(zhì)量管理體系分為質(zhì)量保證和質(zhì)量控制，貫穿液體活檢的整個實施流程，即從分析前、 分析中到分析后。完善的質(zhì)量管理和控制用于確保檢測系統(tǒng)穩(wěn)定性和結果可靠性，有效避免誤差，為臨床腫瘤診療提供更為準確的證據(jù)。
1.質(zhì)控品的選擇
質(zhì)控品選擇在質(zhì)量管理中具有關鍵性作用。應按照定性或定量的實驗目的選擇合適的陰性、弱陽性、陽性質(zhì)控品，以期達到理想的質(zhì)量管理質(zhì)量。
2.分析前質(zhì)量管理
關注患者狀態(tài)。標本采集時的患者狀態(tài)將影響檢測結果，如基礎狀態(tài)、治療方案、腫瘤轉(zhuǎn)移情況，因此選擇適當?shù)牟杉瘯r間點極為重要。標本采集、運輸和預處理需要嚴格按照液體活檢標準操作程序（standard operating procedure,SOP）實施 。
3.分析中質(zhì)量管理
3.1 室內(nèi)質(zhì)控
建議優(yōu)選商品化的質(zhì)控品，質(zhì)控品的選擇和構建首先需注意與臨床患者標本的模擬度，同時保證組份穩(wěn)定且均一，數(shù)量充足，便于長時間分析：
3.1.1 質(zhì)控品配制：
建議由經(jīng)驗豐富的專業(yè)人員在專門區(qū)域進行構建、配制和分裝，切勿在臨床標本操作區(qū)域。自建質(zhì)控品要求采用高靈敏的檢測方法進行評價。
3.1.2 質(zhì)控要求：
對于定性檢測項目，建議運行弱陽性、陰性質(zhì)控品以及空白對照；對于定量檢測項目，建議運行定值、陰性質(zhì)控品以及空白對照。
3.1.3 質(zhì)控規(guī)則：
無論是商品化或自建質(zhì)控品，實驗室需建立質(zhì)控的可接受標準。定量檢測項目建議使用質(zhì)控圖和設定的質(zhì)控規(guī)則。
3.2 室間質(zhì)評：
3.2.1 室間質(zhì)量評價(extemal quality assessment, EQA)：
通過參加國內(nèi)外相關的 EQA 評價實驗室檢測能力，分析和總結能力比對的結果，關注評價結果的趨勢或改變。
3.2.2 其他評價方式：
對于室間質(zhì)量評價計劃的檢測項目，建議與外部實驗室相同或相近的方法比對。
通過這篇專家共識，我們發(fā)現(xiàn)市面上針對液體活檢ctDNA檢測的大小panel雖然數(shù)不勝數(shù)，但是要尋找一個來源于臨床病人樣本細胞系，有明確的拷貝數(shù)，明確的等位基因數(shù)，滿足基因組異質(zhì)性，腫瘤細胞遺傳特性的商業(yè)化標準品卻很難。
面對市場的強烈需求，菁良基因基于現(xiàn)有的幾百多株來源于臨床樣本的細胞系，排除萬難，制作出了可同時滿足流程優(yōu)化和驗證，室內(nèi)質(zhì)評，室間質(zhì)評的肺癌ctDNA標準品套裝。
ctDNA標準品套裝優(yōu)勢
產(chǎn)品形式為ctDNA，片段長度分布在160bp左右。
套裝形式，包含三管獨立的標準品。
三管獨立標準品，各自都有ddPCR驗證的8個突變位點。
三管產(chǎn)品中的8個突變位點都相同。
三管產(chǎn)品中的8個突變位點，等位基因突變頻率分別是1%，0.5%，野生型。
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ctDNA標準品套裝適用場景
可用于基于PCR分析性能驗證項目中特異性、敏感度、測定下限、重復性、準確性、抗干擾能力六項的驗證。
可用于NGS方法性能驗證中陽性預期值(Positive Predictive Value,PPV)、陽性百分比一致性、重復性、可報告范圍/參考范圍、最低檢出限、抗干擾性能、臨床有效性、及生信分析流程確認。
在室內(nèi)質(zhì)控中，強陽、弱陽及陰性對照產(chǎn)品結合，可以用來定性檢測項目。
在室內(nèi)質(zhì)控中，定值、陰性標準品以及空白對照結合，可以用來定量檢測項目。
在室間質(zhì)評中，可以用作標準品分發(fā)給各實驗室，驗證各實驗室檢測靈敏度和精確性。
如果您有意向這款 ctDNA 套裝標準品，持續(xù)關注我們，敬請期待！
