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轉載自生物通：

質譜是蛋白質組學目前的主流技術，可以一次性分析復雜樣品中上萬種蛋白質。但質譜的重現(xiàn)性一直是一個大的問題。同一個樣品做兩次質譜實驗，鑒定到的蛋白質都有較大的不同，重現(xiàn)性（即兩次都能鑒定到的蛋白數量占總鑒定數的百分比）一般只能達到65-85%。

2017年Nature Communications上的一篇文章指出(Collins et al., Nature Communications 8:291)，只有約一半的蛋白質能在SWATH質譜技術中被重復鑒定到，而SWATH已經被認為是重現(xiàn)性相對較高的質譜技術了。Science 曾組織專題研討會討論如何提高質譜的重現(xiàn)性，指出現(xiàn)有質譜的重現(xiàn)性遠遠不能滿足生物標志物(biomarker)的要求。重現(xiàn)性問題如果不能得到很好的解決，那么基于質譜的生物標志物發(fā)現(xiàn)及臨床應用將十分困難。

受限于當前質譜技術的原理，想將重現(xiàn)性穩(wěn)定地提高到95%甚至99%以上，非常困難，甚至一度被認為是“不可能的任務”、“只能等待革命性的質譜儀器突破”。

但科學的發(fā)展就是不斷“挑戰(zhàn)不可能”的過程。日前發(fā)表的一篇論文顯示，暨南大學張弓、何慶瑜課題組已在現(xiàn)有質譜儀上，實現(xiàn)了高達99.8%的重現(xiàn)性。

該研究使用了基于“數據非依賴性采集”(DIA)的HRM-MS方案，對大腸桿菌全蛋白質組進行了質譜測定。在兩個不同菌株的全蛋白質組兩次生物學重復測定中，實現(xiàn)了99.7%和99.8%的重現(xiàn)性，距離完美重現(xiàn)僅一步之遙。不僅重現(xiàn)性極高，其蛋白質鑒定數量也創(chuàng)造了大腸桿菌蛋白質組單次鑒定量的世界紀錄。

同時，其定量重現(xiàn)性也超越了以往所有的大腸桿菌蛋白質質譜的水平，相關系數R=0.982, 在低豐度蛋白的鑒定能力和定量重復性上更是遠勝傳統(tǒng)技術。

這一極高重現(xiàn)性的質譜技術，使得暨南大學和德國夏洛特醫(yī)科大學的研究者們得以以前所未有的精度揭示細菌操縱子的調控規(guī)律，這是以前所不能達到的。這項研究成果也充分顯示出了高重現(xiàn)性質譜的威力。

這一成果的發(fā)表，標志著中國在質譜技術上已達到國際**水平，也使得蛋白質組質譜質控標準成為可能。本研究也得到了科技部國家重點研發(fā)計劃《醫(yī)學生命組學數據質量控制關鍵技術研發(fā)與應用》的支持。未來，質譜行業(yè)將得以規(guī)范化、精準化，重現(xiàn)性不合格的機構將退出市場，從而使蛋白質組技術能真正應用于臨床。