干貨來襲|液體活檢,你真的了解嗎?-技術前沿-資訊-生物在線

干貨來襲|液體活檢,你真的了解嗎?

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2020-05-08T10:41 (訪問量:8397)

基因檢測的應用變革了整個腫瘤的診斷和治療格局,已經成為腫瘤診療中必不可少的關鍵步驟。相比組織

活檢的局限性,循環腫瘤 DNA(ctDNA)創造了更多的非侵入式診斷、治療和監測的可能性。

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含義和特性

ctDNA 是從腫瘤細胞脫落的游離 DNA(cfDNA),由腫瘤細胞分泌或細胞死亡后釋放入血。ctDNA 是小片段 DNA,通常少于 200 個核苷酸。循環中 ctDNA 存在時間很短,半衰期僅有 2 小時。

ctDNA 具有體細胞突變,借此和其他 cfDNA 得以區分。

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ctDNA檢測的優點

1、不需要侵入性步驟,避免了組織活檢的風險和取樣不足問題;

2、腫瘤具有時空異質性,組織活檢只能給出某一時間點某一部分的「快照」;ctDNA 來自于所有部位的腫瘤,可能更準確地反映整個腫瘤全貌;

3、半衰期短,可以作為追蹤幾小時內治療反應的動態工具。


ctDNA檢測的缺點

1、腫瘤負荷較小時,不能敏感檢測到微量的 DNA 變異;

2、不穩定,分析前有降解可能。

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檢測方法

由于 ctDNA 含量很少,所以需要高度敏感的檢測手段。常用的檢測技術包括測序和數字 PCR(dPCR)。

測序可以分析特定靶點乃至全外顯子或基因組數據,可以同時檢測多種突變。dPCR 檢測含量可達到0.01%。雖然敏感性和特異性都高,但一次只有一種探針,檢測效率受到突變數量影響。


ctDNA檢測在臨床中的應用

預后價值

ctDNA 可以預測預后和治療反應。ctDNA 含量和分期及腫瘤大小相關,進展期腫瘤的 ctDNA 是早期腫瘤的 10~100 倍,而具有高腫瘤負荷的患者預后不良,因此 ctDNA 可以測量疾病負荷和預后。

一項結腸癌術后檢測 ctDNA 的研究中,可檢測到 ctDNA 的患者 2 年 RFS 率是 48%,而未檢測到的患者是 100%。在預測復發上的敏感性和特異性是 100%。

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分子分層,指導治療

檢測 ctDNA 中的 EGFR 突變已經用于非小細胞肺癌的臨床。中國學者主持的 BENEFIT 研究是一項 ctDNA 為基礎的 EGFR 分析指導 EGFR TKI 治療的前瞻性研究。研究發現血檢和組織學檢測的一致性高,可以彌補組織學的不足。

而且在治療有效時,ctDNA 水平下降,有助于早期判斷療效。雖然特異性高,但是 ctDNA 檢測僅具有中度敏感性,含量太少時可能造成假陰性,這時候需要組織活檢確認。


早期發現腫瘤耐藥復發

很多研究表明腫瘤對治療有反應時,ctDNA 水平降低,而疾病進展時又再度升高,因此可以提前于影像學發現腫瘤復發,有可能創造在臨床進展前改變治療方案的機會。但是還沒有證據支持在 ctDNA 進展而無臨床進展時改變治療的策略可以改善結局。此外,一些研究表明 ctDNA 反應并不一定總和影像學反應平行。

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腫瘤篩查

近期研究表明,聯合蛋白質和 cfDNA 篩查腫瘤,篩查出 II 期腫瘤的敏感性為 73%,I 期腫瘤敏感性為 49%,而特異性>90%。但是循環基因變異還可能來自于轉化過程初期細胞,可能在臨床上并沒有重要意義。ctDNA 篩查的假陽性范圍還難以界定,因此可能會帶來過度診斷的問題。

ctDNA 檢測方便而靈活,在腫瘤診療的眾多領域中都具有巨大潛力。這個血液中的小小腫瘤指紋,有望開創新的分子病理學范例,通過精準腫瘤學而改變癌癥治療的未來。

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菁良基因ctDNA標準品

產品特點

?產品包含套裝形式,可以測低至0.1%的LOD

?驗證常見的熱門基因突變位點及突變形式

?產品平均片段分布在160bp左右:最大程度接近真實血漿ctDN**段分布

?細胞來源標準品,最大程度模擬患者樣本

?所有位點的AF皆通過ddPCR驗證

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產品應用


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