專家共識|同源重組修復缺陷臨床檢測與應用專家共識(2021版)-技術前沿-資訊-生物在線

專家共識|同源重組修復缺陷臨床檢測與應用專家共識(2021版)

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2021-10-14T10:38 (訪問量:9921)

由中國抗癌協會腫瘤標志專業委員會遺傳性腫瘤標志物協作組、中華醫學會病理學分會分子病理學組組織及行業知名專家共同參與撰寫的《同源重組修復缺陷臨床檢測與應用專家共識》于近日在《中國癌癥防治雜志》正式發布。

同源重組修復缺陷(homologous recombination deficiency,HRD)會產生特定的、可量化的、穩定的基因組改變,可通過建立基于基因組特征分析的評估體系來預測腫瘤HRD狀態及其程度,已成為晚期卵巢癌患者臨床應用PARP抑制劑的新型生物標志物,也可能對乳腺癌、前列腺癌等腫瘤的PARP抑制劑和鉑類藥物的臨床用藥具有指導價值。此HRD專家共識結合國內外應用現狀,為臨床提供了以下7條HRD臨床檢測與應用專家共識。


01. HRD定義描述
HRD通常指細胞水平的HRR障礙狀態,HRD會產生可量化的、穩定的基因組改變,目前主要通過LOH、TAI和LST3個指標的綜合檢測得出GIS,臨床實踐中以BRCA1/2基因致病性突變與GIS評估腫瘤HRD狀態。鑒于HRR通路以及細胞信號通路的復雜性,通過臨床檢測方法實現腫瘤細胞HRD全面而準確的評估仍具挑戰。

02. HRD腫瘤臨床病理及分子特征
HRD是惡性腫瘤較為常見的分子標記,卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌發生率較高;HRD陽性卵巢癌、乳腺癌表現出一定的臨床病理學特征,BRCA相關的遺傳性乳腺癌和卵巢癌表現更顯著。HRD是較穩定的惡性腫瘤分子標記,其評估通常不受腫瘤取材部位(同一部位不同病灶或原發和轉移病灶)影響。

03.HRD臨床檢測的應用價值
HRD臨床檢測在PARP抑制劑治療晚期卵巢癌療效預測中具有重要的應用價值,可對卵巢癌患者進行分層,優化相應治療決策,最大限度擴大PARP抑制劑臨床獲益人群;在乳腺癌、胰腺癌、前列腺癌中,其對PARP抑制劑或含鉑類藥物的臨床應用可能也具有潛在的指導價值,相關研究尚在探索中。另外,我國尚無獲批的HRD檢測試劑,臨床實施檢測時應依據患者腫瘤類型、分期與診療史,并在患者充分知情同意前提下,選擇與適應證和(或)擬應用的PARP抑制劑種類最匹配且經嚴格性能驗證的商業試劑盒。

04.HRD臨床檢測規范化
HRD檢測優先選擇3年以內的石蠟包埋腫瘤組織,并觀察腫瘤細胞的含量和數量,以保證有足夠的腫瘤細胞用于檢測;若含量不足,應進行富集,盡可能避免出血和壞死區域。新鮮組織不推薦作為常規檢測樣本類型,若使用需先評估其腫瘤細胞含量。建議提供患者配對外周血作為非腫瘤對照樣本,這有助于了解胚系BRCA1/2以及其他HRR相關基因突變情況。

05.HRD檢測技術選擇與確認
基于SNPs的“基因組瘢痕”分析是當前最具應用前景的HRD臨床檢測方法,能從BRCA野生型腫瘤患者中有效篩選出PARP抑制劑治療的潛在獲益人群。當前亟待推進我國相應合規試劑盒的開發與驗證工作,其SNPs位點選擇與Panel設計應著重把握我國人群的分子遺傳學特征,并積極倡導聯合開展PARP抑制劑前瞻性多中心臨床研究驗證。

06.HRD算法的標準化及精準化
在HRD臨床檢測中,基于SNPs位點信息進行HRD評分計算的準確度主要依賴于對SCNV的準確分析;同時,通過WGS、WES等檢測技術獲取更多的基因組信息,有助于進一步提升HRD評分計算的準確度;應用人工智能技術輔助分析HRD的多維度特征,已展示出高效識別HRD陽性人群的潛在優勢。必須強調的是,任何一種檢測方法、評分計算方法和判斷標準在臨床正式應用前,都需要經過嚴格的性能分析與臨床效能驗證。

07.HRD報告建議
HRD臨床檢測報告內容除重點描述BRCA1/2等HRR相關基因變異情況以及GIS計算數值外,還應針對相應癌種的PARP抑制劑療效預測價值進行解讀;HRD評分閾值判定與不同癌種、不同PARP抑制劑及其相應適應證有關。同時,目前尚缺乏HRD評分應用于中國人群PARP抑制劑療效預測的大樣本臨床研究數據,報告應著重闡述其檢測的局限性。


目前臨床上主要通過檢測基因組瘢痕或HRR基因突變間接評估HRD的狀態,但哪些生物標志物應納入HRD狀態評估尚無統一標準,在HRD評估中也還有許多問題亟待解決。

HRD檢測和臨床應用的標準化仍任重而道遠,但其應用前景值得期待。目前,全球范圍內僅有2款HRD檢測產品獲批,國內尚無NMPA批準的HRD檢測產品。

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