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泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品WES數(shù)據(jù)大揭秘!

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2019-09-06T13:44 (訪問量:12176)


8月,菁良基因重磅推出2019最不容錯(cuò)過之優(yōu)品—泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品!它包含近800位點(diǎn),經(jīng)過數(shù)字PCRWES雙重驗(yàn)證,作為全球最大腫瘤基因檢測標(biāo)準(zhǔn)品,自然受到諸多關(guān)注,今天我們就揭開WES數(shù)據(jù)的神秘面紗。




泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品 WES 檢測基因與多個(gè)Cancer Panel 檢測基因有相當(dāng)高的重疊度,具體情況如下:



泛腫瘤800 gDNA標(biāo)準(zhǔn)品采用了IDT xGenExome Research PanelV1.0的捕獲探針,及IlluminaHiSeq X ten測序平臺,進(jìn)行500X全外顯子測序,并與上面的8個(gè)Panel檢測的基因進(jìn)行比對,挑選出外顯子變異數(shù)據(jù)涵蓋的基因。(具體基因列表在最后)


其中不同腫瘤類型的熱門基因歸納如下:



WES數(shù)據(jù)可實(shí)現(xiàn)用途


檢測流程準(zhǔn)確性

根據(jù)官網(wǎng)的500X WES數(shù)據(jù),挑選其中自有Cancer Panel所包含的位點(diǎn),與自有Panel檢測泛腫瘤800 gDNA檢測標(biāo)準(zhǔn)品的結(jié)果進(jìn)行比較,可以作為流程檢測準(zhǔn)確性的重要參考。通過比較官網(wǎng)的500X WES數(shù)據(jù)與不同平臺檢測該標(biāo)準(zhǔn)品的WES數(shù)據(jù)結(jié)果,作為驗(yàn)證不同平臺間WES檢測流程準(zhǔn)確性的參考。


驗(yàn)證樣品重復(fù)性

用同一標(biāo)準(zhǔn)品,用自有Panel進(jìn)行多次檢測,在符合準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上,可以進(jìn)行樣品重復(fù)性的驗(yàn)證。


突變頻率的檢測

WES數(shù)據(jù)包含的突變位點(diǎn)頻率分布范圍較廣,可以用來作為不同突變頻率檢測及檢測限的參考。


突變類型的檢出

WES數(shù)據(jù)包含的突變類型較多,可以作為不同突變類型是否檢出的參考。


WES數(shù)據(jù)列表


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