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泛腫瘤800 gDNA標準品WES數據大揭秘!

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2019-09-06T13:44 (訪問量:11151)


8月,菁良基因重磅推出2019最不容錯過之優品—泛腫瘤800 gDNA標準品!它包含近800位點,經過數字PCRWES雙重驗證,作為全球最大腫瘤基因檢測標準品,自然受到諸多關注,今天我們就揭開WES數據的神秘面紗。




泛腫瘤800 gDNA標準品 WES 檢測基因與多個Cancer Panel 檢測基因有相當高的重疊度,具體情況如下:



泛腫瘤800 gDNA標準品采用了IDT xGenExome Research PanelV1.0的捕獲探針,及IlluminaHiSeq X ten測序平臺,進行500X全外顯子測序,并與上面的8Panel檢測的基因進行比對,挑選出外顯子變異數據涵蓋的基因。(具體基因列表在最后)


其中不同腫瘤類型的熱門基因歸納如下:



WES數據可實現用途


檢測流程準確性

根據官網的500X WES數據,挑選其中自有Cancer Panel所包含的位點,與自有Panel檢測泛腫瘤800 gDNA檢測標準品的結果進行比較,可以作為流程檢測準確性的重要參考。通過比較官網的500X WES數據與不同平臺檢測該標準品的WES數據結果,作為驗證不同平臺間WES檢測流程準確性的參考。


驗證樣品重復性

用同一標準品,用自有Panel進行多次檢測,在符合準確性的基礎上,可以進行樣品重復性的驗證。


突變頻率的檢測

WES數據包含的突變位點頻率分布范圍較廣,可以用來作為不同突變頻率檢測及檢測限的參考。


突變類型的檢出

WES數據包含的突變類型較多,可以作為不同突變類型是否檢出的參考。


WES數據列表


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