無創產前篩查發展新方向,菁良單基因遺傳病定制化產品來助陣-技術前沿-資訊-生物在線

無創產前篩查發展新方向,菁良單基因遺傳病定制化產品來助陣

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2021-11-26T16:38 (訪問量:10226)

單基因遺傳病是同源染色體中單個基因突變(顯性遺傳病)或者一對等位基因均發生突變(隱性遺傳?。┮鸬倪z傳病,不受環境因素影響,又稱孟德爾遺傳病。

單基因遺傳病大多屬于罕見病,但其種類多達到10000種以上,其中約4000多種致病基因和發病機制比較明確。若把這上萬種單基因遺傳病的發生率累計起來,單基因遺傳病的總體發生率可達2%~3%。

由于單基因遺傳病往往致死、致殘,且大多困擾終生,難于治療,對患者的生活質量將產生極大的影響,所以產前診斷預防單基因遺傳病尤為重要。

單基因病無創檢測發展歷程

傳統的單基因遺傳病產前診斷方法多為有創性操作,侵入性產前診斷雖然準確度高,但存在約1%的流產風險。與侵入性產前診斷比較,無創產前檢測無流產、感染等風險,操作簡單,對需要進一步檢測的孕婦群體更容易接受。

由于單病種單基因遺傳病較少,某些患者存在特異突變,以及檢測技術分析較為復雜等原因,NIPT在單基因遺傳病的應用方面發展相對較慢。隨著新技術的不斷出現,單基因遺傳病的NIPT研究有了較大進展。
1997年在妊娠男性胎兒孕婦的外周血中檢測到Y染色體性別決定基因,證實孕婦外周血中存在胎兒游離DNA。
2000年有研究者利用胎兒游離DNA檢測強直性肌營養不良。
2012年英國國家醫療服務體系(NHS)批準了軟骨發育不全和致死性骨發育不良等疾病的無創產前輔助診斷,這是單基因病無創產前檢測首次被用于臨床。
2017年美國Baylor Genetics發布了無創產前多基因檢測產品PreSeek,可一次檢測30個基因,44種顯性單基因病。

單基因病無創檢測最優方法

NIPT和NIPT plus,通常使用的是低深度全基因組測序,無法檢測單個基因的單堿基突變或小的插入/缺失;而高深度的全基因組測序,不具備臨床適用性。

多重PCR后高通量測序理論上也可以用于單基因病篩查,但實際上,對于單個突變位點,如果這個引物不合適或優化得不好造成對目標片段的脫扣,就可能造成漏檢。盡管存在突變熱點,單基因病的檢測必須覆蓋全部外顯子、剪接區域甚至部分內含子區域。

所以技術方案上探針捕獲靶向高通量測序是目前最優方法。

單基因病無創檢測發展難點

無創產前篩查單個單基因病,臨床意義有限,所以需要對更多疾病組合檢測,這大大提高了技術的難度,比無創產前檢測染色體異常難度要高出很多。

此外探針捕獲靶向高通量測序技術難點還體現在以下三點:
雜交捕獲建庫如何保證相對一致的雜交捕獲效率從而不發生漏檢情況
準確檢測低豐度突變對生信算法的要求較高

本地數據庫的病例豐富度及準確解讀
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菁良解決方案

NIPT經過多年推廣,已經得到了廣泛應用和認可,但NIPT只篩查染色體異常,毫無疑問,單基因病已經成為無創產前篩查領域新的熱點和焦點。

菁良單基因遺傳病定制化產品可助力用戶試劑盒開發和注冊申報,并監測和修正實驗方案、規范操作及生物信息學分析過程等,加快臨床認可及規模化應用步伐。



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