
△ 肺癌分型(來源/clinical care oncology)
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肺腺癌的主要融合基因及頻率
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我國每年新發非小細胞肺癌(NSCLC)患者約80萬,預計有12萬患者攜帶基因融合突變。臨床數據研究發現,基因融合在NSCLC腺癌的基因突變占比中僅次于KRAS和EGFR,屬于第三大類突變。融合合并突變頻率約為15%。
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NSCLC中的肺腺癌是靶向治療比較多的癌種類型,其中基因融合突變的主要類型和頻率為:
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靶向藥及融合基因檢測
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截至到2020年5月8日RET靶向藥LOXO-292獲批,常見融合突變的靶向藥已覆蓋100%。融合突變雖然低頻,但靶向藥預后好,且可序貫用藥。
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△ 基因融合突變的靶向藥(來源/醫世象)
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隨著靶向藥的上市,也有越來越多的伴隨診斷檢測試劑盒被FDA和NMPA批準,目前已經有多種融合基因檢測已被納入NCCN指南常規推薦。
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在2020版的《非小細胞肺癌NCCN指南》中明確指出,對于通過多基因NGS 檢測未發現驅動基因突變的患者,建議行RNA-NGS檢測,從而更大程度地發現融合事件。
在2020版《結直腸癌NCCN指南》中,專家建議對于已用IHC檢測NTRK融合陽性的患者,由于檢測方法的局限性可能存在假陽性率高的現象,故而推薦再用RNA-NGS確診。
NCCN指南的推薦體現出了融合基因檢測的重要性,通過融合檢測最大化的匹配靶向用藥,已經成為腫瘤精準治療的中流砥柱。
目前,融合基因的檢測方法包括傳統的熒光原位雜交(FISH)、PCR擴增技術(RT-PCR)、免疫組化(IHC)以及NGS等技術。每種技術都各有優劣勢,但是在RNA水平上行NGS檢測融合基因相較于DNA水平上天然存在各種優勢,RNA水平融合的靶基因功能相關性更強。
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菁良基因解決方案
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技術革新和發展為臨床分子檢測平臺開拓更大的發展空間和應用價值,但同時伴隨而來的是檢測錯誤率和問題復雜性。標準化管理和質量控制是保證結果準確的必要條件。
菁良基因融合標準品的使用可以確保臨床分子檢測項目在醫院的有序開展,不同類型的標準品的組合搭配使用可以滿足當下臨床需求,確保臨床報告的公信力。
菁良基因的腫瘤融合FFPE標準品,包含6個RT-PCR驗證的融合表達位點,及數字PCR驗證的4個基因融合位點,成品為福爾馬林固定,石蠟包埋處理的FFPE切片,主要用于基因融合檢測流程的質量控制和性能驗證。
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△ 腫瘤融合FFPE標準品的位點信息
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菁良腫瘤融合FFPE標準品還有以下特點:
? 樣本來源于人類細胞系:最大程度接近患者樣本
? 兼容主流檢測平臺:PCR,NGS
? 覆蓋常見熱門融合基因(ALK,RET,ROS1,NTRK1,NTRK3等)及RNA融合表達等多種腫瘤融合
? 在ISO9001認證的質量管理體系下穩定生產
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此外,該標準品適用于PCR及NGS平臺,可以用于基因融合檢測panel的性能驗證、日常質控、實驗室室內及室間質評、 DNA及RNA提取效率的驗證、實驗室檢測試劑盒/檢測流程篩選比較、實驗室初始化時設備和流程校驗等。
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參考資料:
1. ALK Gene Rearrangements:A New Therapeutic Target in a Molecularly Defined Subset of Non-small Cell Lung Cancer,GENE OF THE MONTH J Thorac Oncol. 2009;4: 1450–1454
2. Updated Molecular Testing Guideline for the Selection of Lung Cancer Patients for Treatment With Targeted Tyrosine Kinase Inhibitors;Journal of Thoracic Oncology
3. Recent Advances in Targeting ROS1 in Lung Cancer;Journal of Thoracic Oncology Vol. 12 No. 11:611-1625
4. Clinical and Translational Implications of RET Rearrangements in Non–Small Cell Lung Cancer;Journal of Thoracic Oncology Vol. 13 No. 1: 27-45
5. MET Exon 14 Mutations in Non–Small-Cell Lung Cancer Are Associated With Advanced Age and Stage-Dependent MET Genomic Amplification and c-Met Overexpression;J Clin Oncol 34:721-730.
6. Non-Small Cell Lung Cancer;NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology (NCCN Guidelines?)
7. Diagnosis of fusion genes using targeted RNA sequencing;NATURE COMMUNICATIONS | https://doi.org/10.1038/s41467-019-09374-9 2 NATURE
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