標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范 | 靶向高通量測序在感染性疾病中應(yīng)用與實(shí)踐專家共識(shí)-國內(nèi)聚焦-資訊-生物在線

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標(biāo)準(zhǔn)與規(guī)范 | 靶向高通量測序在感染性疾病中應(yīng)用與實(shí)踐專家共識(shí)

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2024-12-25T00:00 (訪問量:45903)

近日,由中國醫(yī)療保健國際交流促進(jìn)會(huì)臨床微生物學(xué)分會(huì)、北京大學(xué)人民醫(yī)院王輝教授、中日友好醫(yī)院曹彬教授領(lǐng)銜制定的《靶向高通量測序在感染性疾病中應(yīng)用與實(shí)踐專家共識(shí)》正式見刊《中華醫(yī)學(xué)雜志》,為tNGS技術(shù)在感染性疾病的規(guī)范應(yīng)用提出了指導(dǎo)意見。

《共識(shí)》明確規(guī)范了靶向高通量測序 (tNGS) 的臨床適應(yīng)癥、技術(shù)要點(diǎn)、干濕實(shí)驗(yàn)室建設(shè)、報(bào)告發(fā)放等醫(yī)學(xué)診斷的全流程,意味著tNGS在感染性疾病診斷中的應(yīng)用有了行業(yè)認(rèn)可和可遵循的檢測標(biāo)準(zhǔn)、方法,確保實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)化操作,消除不同方法帶來的結(jié)果誤差,助力疾病精準(zhǔn)診斷邁向新高度。

tNGS的應(yīng)用場景應(yīng)與mNGS有所區(qū)別和側(cè)重。對(duì)于非重癥患者,傳統(tǒng)微生物學(xué)檢測陰性時(shí),考慮送檢tNGS;病情危重或新發(fā)突發(fā)傳染病時(shí),考慮送檢mNGS。

圖1 tNGS/mNGS選擇及tNGS臨床解讀處置流程

靶向高通量測序(tNGS)技術(shù)要點(diǎn)

引物/探針設(shè)計(jì)

共識(shí)9:建議tNGS引物或探針設(shè)計(jì)遵循特異、保守、堿基均勻的原則,引物/探針及目的片段大小應(yīng)控制在適當(dāng)?shù)姆秶鐢U(kuò)增子長度宜在200 bp內(nèi),探針長度宜介于80~120 bp。引物和探針需完成干實(shí)驗(yàn)和濕實(shí)驗(yàn)的性能評(píng)價(jià)。

防污染措施

1、實(shí)驗(yàn)室防污染措施

共識(shí)10:tNGS實(shí)驗(yàn)過程中靶標(biāo)被極大富集,核酸污染風(fēng)險(xiǎn)大,建議對(duì)實(shí)驗(yàn)室環(huán)境、試劑、實(shí)驗(yàn)操作、廢棄物處理等制定嚴(yán)格的防污染制度和預(yù)案,并定期監(jiān)測實(shí)驗(yàn)室核酸污染。

2、生物信息降噪措施

共識(shí)11:試劑工程菌、背景環(huán)境菌、環(huán)境中的氣溶膠可能導(dǎo)致假陽性結(jié)果。建議通過生物信息分析建立試劑和環(huán)境的基線數(shù)據(jù)庫,以提高檢測準(zhǔn)確性和可靠性。

3、性能確認(rèn)

共識(shí)12:tNGS檢測中引物/探針、酶等關(guān)鍵原材料或檢測流程中關(guān)鍵參數(shù)的調(diào)整可能影響檢測性能。建議每次優(yōu)化后的試劑和流程進(jìn)行性能確認(rèn)。

4、質(zhì)控

共識(shí)13:建議進(jìn)行全流程質(zhì)控,包含陰性對(duì)照、陽性對(duì)照、內(nèi)參、數(shù)據(jù)量、數(shù)據(jù)質(zhì)量等,且在臨床報(bào)告中體現(xiàn)質(zhì)控結(jié)果

 
菁良科技根據(jù)國內(nèi)外病毒類核酸及宏基因組檢測對(duì)于質(zhì)控品的需求,可提供DNA病毒、RNA病毒、革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、真菌、支原體/衣原體等病原體質(zhì)控品。客戶可根據(jù)檢測需求,定制不同核酸形式,不同產(chǎn)品形式,不同規(guī)格等質(zhì)控品。

菁良科技宏基因組測序質(zhì)控品

  產(chǎn)品特點(diǎn)  

菌種豐富:革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌、真菌等多種可選

菌種可混合:可根據(jù)客戶需要提供單種菌類及混合多種菌類的產(chǎn)品

產(chǎn)品形式多樣:菌株及菌株gDNA形式可選

質(zhì)量體系:ISO13485

目錄產(chǎn)品列表  

保質(zhì)期:-80℃,24個(gè)月

產(chǎn)品規(guī)格:1.00E+08 CFU/mL , 1mL/支

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

GW-INF001

金黃色葡萄球菌質(zhì)控品

GW-INF002

肺炎克雷伯菌質(zhì)控品

GW-INF003

肺炎鏈球菌質(zhì)控品

GW-INF004

銅綠假單胞菌質(zhì)控品

GW-INF005

白色念珠菌質(zhì)控品

GW-INF006

鮑曼不動(dòng)桿菌質(zhì)控品

GW-INF007

大腸埃希菌質(zhì)控品

GW-INF008

表皮葡萄球菌質(zhì)控品

GW-INF009

糞腸球菌質(zhì)控品

GW-INF010

單核細(xì)胞增生李斯特菌質(zhì)控品

GW-INF011

流感嗜血桿菌質(zhì)控品

GW-INF012

新生隱球菌質(zhì)控品

菁良科技病毒核酸檢測質(zhì)控品

  產(chǎn)品特點(diǎn)  

滅活病毒:最接近臨床樣本,可質(zhì)控病原裂解、核酸提取、擴(kuò)增全過程。

精準(zhǔn)定量:使用液滴式數(shù)字PCR對(duì)病毒拷貝數(shù)精準(zhǔn)定量。

高特異性:基因測序驗(yàn)證序列,可溯源,確保檢測穩(wěn)定可靠。

安全性高:熱滅活處理,經(jīng)驗(yàn)證無感染活性

  產(chǎn)品列表  

保質(zhì)期:-80℃及以下,24個(gè)月;

產(chǎn)品規(guī)格:≥1.00E+08 Copies/mL, 0.1mL/支

產(chǎn)品編號(hào)

產(chǎn)品名稱

GW-IAF101

人類皰疹病毒(HHV-6B)核酸參考品

GW-IAF102

水痘帶狀皰疹病毒(VZV)核酸參考品

GW-IAF103

單純皰疹病毒1型(HSV-1)核酸參考品

GW-IAF104

單純皰疹病毒2型(HSV-2)核酸參考品

GW-IAF105

EB病毒(EBV)核酸參考品

GW-IAF106

人巨細(xì)胞病毒(CMV)核酸參考品

GW-IAF110

甲型流感病毒(H1N1)核酸參考品

GW-IAF111

甲型流感病毒(H1N1 pdm)核酸參考品

GW-IAF112

甲型流感病毒(H3N2)核酸參考品

GW-IAF113

乙型流感病毒(Yamagata)核酸參考品

GW-IAF114

乙型流感病毒(Victoria)核酸參考品

GW-IAF115

副流感病毒1型(PIV-1)核酸參考品

GW-IAF116

副流感病毒2型(PIV-2)核酸參考品

GW-IAF117

副流感病毒3型(PIV-3)核酸參考品

GW-IAF118

副流感病毒4B型(PIV-4B)核酸參考品

GW-IAF119

呼吸道合胞病毒A型(RSV-A)核酸參考品

GW-IAF120

呼吸道合胞病毒B型(RSV-B)核酸參考品

GW-IAF121

人偏肺病毒A1型(hMPV-A1)核酸參考品

GW-IAF122

人偏肺病毒B2型(hMPV-B2)核酸參考品

GW-IAF123

腺病毒1型(HAdV-1)核酸參考品

GW-IAF124

腺病毒2型(HAdV-2)核酸參考品

GW-IAF125

腺病毒3型(HAdV-3)核酸參考品

GW-IAF126

腺病毒4型(HAdV-4)核酸參考品

GW-IAF127

腺病毒5型(HAdV-5)核酸參考品

GW-IAF128

腺病毒7型(HAdV-7)核酸參考品

GW-IAF129

人鼻病毒A2型(HRV-A2)核酸參考品

GW-IAF130

人鼻病毒B42型(HRV-B42)核酸參考品

GW-IAF131

人冠狀病毒229E型(HCoV-229E)核酸參考品

GW-IAF132

人冠狀病毒OC43型(HCoV-OC43)核酸參考品

GW-IAF133

人冠狀病毒NL63型(HCoV-NL63)核酸參考品

GW-IAF134

柯薩奇病毒A2型(CA2)核酸參考品

GW-IAF137

柯薩奇病毒A16型(CA16)核酸參考品

GW-IAF138

腸道病毒68型(EV68)核酸參考品

GW-IAF139

腸道病毒71型(EV71)核酸參考品

GW-IAF140

風(fēng)疹病毒(RV)核酸參考品

GW-IAF142

流行性腮腺炎病毒核酸參考品

關(guān)于菁良

菁良科技(深圳)有限公司是全球領(lǐng)先的提供體外檢測標(biāo)準(zhǔn)品的研發(fā)創(chuàng)新型高科技企業(yè)。

體外檢測需要標(biāo)準(zhǔn)品!隨著經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展,科技細(xì)分領(lǐng)域的不斷拓展,國民生活水平的不斷提高,檢驗(yàn)檢測市場需求也隨之快速上升,體外檢測進(jìn)入高速發(fā)展階段。然而配套的質(zhì)量控制和規(guī)范化意識(shí)卻相對(duì)滯后,很大一部分體外檢測方法仍然存在效率低下且檢測準(zhǔn)確率有限的情況。菁良通過自主研發(fā)的高科技平臺(tái),向體外檢測行業(yè)用戶及合作伙伴提供全球領(lǐng)先的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)、第三方質(zhì)控產(chǎn)品和研發(fā)參考品服務(wù),助力提高行業(yè)檢測準(zhǔn)確率!

菁良自2018年成立以來,始終以推動(dòng)行業(yè)規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化為己任,參與多項(xiàng)由檢測領(lǐng)域行業(yè)龍頭發(fā)起的標(biāo)準(zhǔn)制定工作,多次支持由臨檢中心發(fā)起的室間質(zhì)量評(píng)價(jià) (EQA)/能力驗(yàn)證項(xiàng)目。菁良擁有全球領(lǐng)先的標(biāo)準(zhǔn)品研發(fā)技術(shù)和資深的國際拓展經(jīng)驗(yàn),已推出眾多行業(yè)首創(chuàng)的參考品和第三方質(zhì)控品,被廣泛用于檢測試劑和儀器的工藝開發(fā)、以及檢測過程之中。菁良秉承著“精準(zhǔn)制標(biāo),匠心良造”的理念,懷抱著“提高體外檢測準(zhǔn)確率,助力精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)快速發(fā)展”的愿景,致力于建立規(guī)范化的中國體外檢測金標(biāo)準(zhǔn)平臺(tái)。

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