標準與規范 | 靶向高通量測序在感染性疾病中應用與實踐專家共識-國內聚焦-資訊-生物在線

標準與規范 | 靶向高通量測序在感染性疾病中應用與實踐專家共識

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2024-12-25T00:00 (訪問量:43199)

近日,由中國醫療保健國際交流促進會臨床微生物學分會、北京大學人民醫院王輝教授、中日友好醫院曹彬教授領銜制定的《靶向高通量測序在感染性疾病中應用與實踐專家共識》正式見刊《中華醫學雜志》,為tNGS技術在感染性疾病的規范應用提出了指導意見。

《共識》明確規范了靶向高通量測序 (tNGS) 的臨床適應癥、技術要點、干濕實驗室建設、報告發放等醫學診斷的全流程,意味著tNGS在感染性疾病診斷中的應用有了行業認可和可遵循的檢測標準、方法,確保實驗室的標準化操作,消除不同方法帶來的結果誤差,助力疾病精準診斷邁向新高度。

tNGS的應用場景應與mNGS有所區別和側重。對于非重癥患者,傳統微生物學檢測陰性時,考慮送檢tNGS;病情危重或新發突發傳染病時,考慮送檢mNGS。

圖1 tNGS/mNGS選擇及tNGS臨床解讀處置流程

靶向高通量測序(tNGS)技術要點

引物/探針設計

共識9:建議tNGS引物或探針設計遵循特異、保守、堿基均勻的原則,引物/探針及目的片段大小應控制在適當的范圍,如擴增子長度宜在200 bp內,探針長度宜介于80~120 bp。引物和探針需完成干實驗和濕實驗的性能評價。

防污染措施

1、實驗室防污染措施

共識10:tNGS實驗過程中靶標被極大富集,核酸污染風險大,建議對實驗室環境、試劑、實驗操作、廢棄物處理等制定嚴格的防污染制度和預案,并定期監測實驗室核酸污染。

2、生物信息降噪措施

共識11:試劑工程菌、背景環境菌、環境中的氣溶膠可能導致假陽性結果。建議通過生物信息分析建立試劑和環境的基線數據庫,以提高檢測準確性和可靠性。

3、性能確認

共識12:tNGS檢測中引物/探針、酶等關鍵原材料或檢測流程中關鍵參數的調整可能影響檢測性能。建議每次優化后的試劑和流程進行性能確認。

4、質控

共識13:建議進行全流程質控,包含陰性對照、陽性對照、內參、數據量、數據質量等,且在臨床報告中體現質控結果。

 
菁良科技根據國內外病毒類核酸及宏基因組檢測對于質控品的需求,可提供DNA病毒、RNA病毒、革蘭氏陰性菌、革蘭氏陽性菌、真菌、支原體/衣原體等病原體質控品??蛻艨筛鶕z測需求,定制不同核酸形式,不同產品形式,不同規格等質控品。

菁良科技宏基因組測序質控品

  產品特點  

菌種豐富:革蘭氏陽性菌、革蘭氏陰性菌、真菌等多種可選

菌種可混合:可根據客戶需要提供單種菌類及混合多種菌類的產品

產品形式多樣:菌株及菌株gDNA形式可選

質量體系:ISO13485

目錄產品列表  

保質期:-80℃,24個月

產品規格:1.00E+08 CFU/mL , 1mL/支

產品編號

產品名稱

GW-INF001

金黃色葡萄球菌質控品

GW-INF002

肺炎克雷伯菌質控品

GW-INF003

肺炎鏈球菌質控品

GW-INF004

銅綠假單胞菌質控品

GW-INF005

白色念珠菌質控品

GW-INF006

鮑曼不動桿菌質控品

GW-INF007

大腸埃希菌質控品

GW-INF008

表皮葡萄球菌質控品

GW-INF009

糞腸球菌質控品

GW-INF010

單核細胞增生李斯特菌質控品

GW-INF011

流感嗜血桿菌質控品

GW-INF012

新生隱球菌質控品

菁良科技病毒核酸檢測質控品

  產品特點  

滅活病毒:最接近臨床樣本,可質控病原裂解、核酸提取、擴增全過程。

精準定量:使用液滴式數字PCR對病毒拷貝數精準定量。

高特異性:基因測序驗證序列,可溯源,確保檢測穩定可靠。

安全性高:熱滅活處理,經驗證無感染活性

  產品列表  

保質期:-80℃及以下,24個月;

產品規格:≥1.00E+08 Copies/mL, 0.1mL/支

產品編號

產品名稱

GW-IAF101

人類皰疹病毒(HHV-6B)核酸參考品

GW-IAF102

水痘帶狀皰疹病毒(VZV)核酸參考品

GW-IAF103

單純皰疹病毒1型(HSV-1)核酸參考品

GW-IAF104

單純皰疹病毒2型(HSV-2)核酸參考品

GW-IAF105

EB病毒(EBV)核酸參考品

GW-IAF106

人巨細胞病毒(CMV)核酸參考品

GW-IAF110

甲型流感病毒(H1N1)核酸參考品

GW-IAF111

甲型流感病毒(H1N1 pdm)核酸參考品

GW-IAF112

甲型流感病毒(H3N2)核酸參考品

GW-IAF113

乙型流感病毒(Yamagata)核酸參考品

GW-IAF114

乙型流感病毒(Victoria)核酸參考品

GW-IAF115

副流感病毒1型(PIV-1)核酸參考品

GW-IAF116

副流感病毒2型(PIV-2)核酸參考品

GW-IAF117

副流感病毒3型(PIV-3)核酸參考品

GW-IAF118

副流感病毒4B型(PIV-4B)核酸參考品

GW-IAF119

呼吸道合胞病毒A型(RSV-A)核酸參考品

GW-IAF120

呼吸道合胞病毒B型(RSV-B)核酸參考品

GW-IAF121

人偏肺病毒A1型(hMPV-A1)核酸參考品

GW-IAF122

人偏肺病毒B2型(hMPV-B2)核酸參考品

GW-IAF123

腺病毒1型(HAdV-1)核酸參考品

GW-IAF124

腺病毒2型(HAdV-2)核酸參考品

GW-IAF125

腺病毒3型(HAdV-3)核酸參考品

GW-IAF126

腺病毒4型(HAdV-4)核酸參考品

GW-IAF127

腺病毒5型(HAdV-5)核酸參考品

GW-IAF128

腺病毒7型(HAdV-7)核酸參考品

GW-IAF129

人鼻病毒A2型(HRV-A2)核酸參考品

GW-IAF130

人鼻病毒B42型(HRV-B42)核酸參考品

GW-IAF131

人冠狀病毒229E型(HCoV-229E)核酸參考品

GW-IAF132

人冠狀病毒OC43型(HCoV-OC43)核酸參考品

GW-IAF133

人冠狀病毒NL63型(HCoV-NL63)核酸參考品

GW-IAF134

柯薩奇病毒A2型(CA2)核酸參考品

GW-IAF137

柯薩奇病毒A16型(CA16)核酸參考品

GW-IAF138

腸道病毒68型(EV68)核酸參考品

GW-IAF139

腸道病毒71型(EV71)核酸參考品

GW-IAF140

風疹病毒(RV)核酸參考品

GW-IAF142

流行性腮腺炎病毒核酸參考品

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菁良科技(深圳)有限公司是全球領先的提供體外檢測標準品的研發創新型高科技企業。

體外檢測需要標準品!隨著經濟的快速發展,科技細分領域的不斷拓展,國民生活水平的不斷提高,檢驗檢測市場需求也隨之快速上升,體外檢測進入高速發展階段。然而配套的質量控制和規范化意識卻相對滯后,很大一部分體外檢測方法仍然存在效率低下且檢測準確率有限的情況。菁良通過自主研發的高科技平臺,向體外檢測行業用戶及合作伙伴提供全球領先的標準物質、第三方質控產品和研發參考品服務,助力提高行業檢測準確率!

菁良自2018年成立以來,始終以推動行業規范化、標準化為己任,參與多項由檢測領域行業龍頭發起的標準制定工作,多次支持由臨檢中心發起的室間質量評價 (EQA)/能力驗證項目。菁良擁有全球領先的標準品研發技術和資深的國際拓展經驗,已推出眾多行業首創的參考品和第三方質控品,被廣泛用于檢測試劑和儀器的工藝開發、以及檢測過程之中。菁良秉承著“精準制標,匠心良造”的理念,懷抱著“提高體外檢測準確率,助力精準醫學快速發展”的愿景,致力于建立規范化的中國體外檢測金標準平臺。

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