近岸類器官課堂-結直腸癌-技術前沿-資訊-生物在線

近岸類器官課堂-結直腸癌

作者:蘇州近岸蛋白質科技股份有限公司 2022-07-05T15:07 (訪問量:7846)

結直腸癌(Colorectal Cancer, CRC)是全世界最常見的癌癥之一。在過去的十年中,預防性篩查項目的推廣使死亡率大幅下降,然而在許多國家范圍內,結直腸癌仍然是癌癥相關死亡的第二大原因【1】。

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幾十年來,癌細胞系和基因編輯小鼠【2】一直是CRC研究的主要模型,人類腫瘤患者衍生異種移植(PDX)也已成為了CRC研究的工具【3】。與此同時,能夠在體外進行長期培養的原發性/轉移性CRC類器官模型進一步擴大了研究人員的選擇范圍。類器官既可以像PDX一樣代表了個體患者的真實腫瘤情況,又兼具了細胞系的可傳代、易于高通量篩選等特性。因此,CRC類器官模型正在廣泛應用于藥物研究、個性化醫療等領域。

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本篇文章基于Nature Chemical Biology【4】、STAR protocols【5】、Nature protocols【6】Cell【7】發表的四篇文章,整理了人類結直腸癌組織來源的類器官培養方案。

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圖1. 病人組織來源的CRC類器官研究方案【8】

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細胞來源

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活檢樣本或手術樣本

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培養基配方

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組織處理

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1. 將新鮮CRC組織樣本放入預冷的PBS中,剔除脂肪組織和壞死的腫瘤組織(通常為黃色或白色),只選取活的腫瘤組織(通常為粉紅色)。

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2. 將CRC組織轉移到含有5 mL預冷的PBS溶液中清洗,去除血液和碎片。為防止污染,需要多次重復此步驟至液體變澄清。

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3. 吸出PBS,將組織切割為1-2 mm3的小塊,此步驟可以留存適量組織用于測序、免疫組化分析等。

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4. 將剩余組織塊切碎,并加入1 ml預冷的類器官培養基,用p1000吸頭將腫瘤碎片懸浮液轉移到含有5 ml解離培養基的離心管中,輕輕震蕩混勻后,放置于37℃培養箱中解離1 h。每隔15min輕輕震蕩或吹打混勻一次。

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5. 加入8ml 預冷的DMEM/F12(含10%FBS)終止消化。

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6. 將懸浮液經過70μm細胞篩網過濾,收集解離的細胞。

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7. 將過濾的細胞懸液在4℃條件下450g離心5min。

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8. 若細胞沉淀有明顯的紅色,則將細胞重懸于5ml的紅細胞裂解液中,冰上孵育10min使紅細胞裂解。

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9. 向細胞懸液中加入5ml DMEM/F12沖洗細胞一次,離心收集細胞沉淀后,加入1-2ml DMEM/F12重懸細胞,并進行臺盼藍染色和細胞計數。

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類器官培養

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10. 將凍存的Matrigel在4℃下過夜解凍,在冰上以3:1的體積比將Matrigel與細胞懸液混合,輕輕吹打混勻避免產生氣泡。

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11. 從37℃培養箱中取出預熱的24孔板,將80μl混合液接種在各孔中,注意需接種在孔的中心,避免接觸側壁。

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12. 將24孔板室溫放置5min后,轉移至37℃,5%CO2的培養箱中孵育10min,使Matrigel固化。

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13. 向每個孔中緩慢滴加650μl 預熱的類器官培養基,確?;|膠被完全覆蓋。放于37℃,5%CO2的培養箱中培養,每2-3天更換培養基(用于換液的類器官培養基內不含Y27632)。

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類器官傳代

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14. 吸出類器官培養液,機械分離Matrigel,然后加入500μl胰蛋白酶,放置于37℃培養箱中孵育1-2min后,用移液器多次吹打,從基質膠中釋放類器官。

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15. 用含有10%FBS的DMEM/F12培養基終止消化,在4℃條件下300g離心5min。

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16. 用冷PBS清洗后,再次4℃條件下300g離心5min。

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17. 將所得沉淀按照1:3-1:5的比例重復10-13步驟(具體比例通過類器官的匯合度確定),完成傳代。

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類器官凍存

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18. 取1-2個孔的類器官,消化離心后取細胞沉淀,加入1ml細胞凍存液。

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19. 將細胞重懸后轉移至凍存管中,利用程序降溫盒緩慢降溫至-80℃。

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20. 第二天,將樣品轉移到液氮中長期儲存。

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類器官復蘇

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21. 將液氮凍存的CRC類器官放置在37℃水浴鍋中進行解凍,水浴時間不宜超過2min。

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22. 將細胞懸液轉移至15ml離心管中,加入10ml預冷的DMEM/F12培養基(含10% FBS)。4℃條件下300g離心5min,取細胞沉淀。

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23. 將所得沉淀重復10-13步驟,完成CRC類器官復蘇。

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圖2. 顯微鏡下CRC類器官的形態,以及Ki-67、E-Cadherin標記物的表達【5】

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利用類器官技術,能夠將CRC和正常結直腸組織在體外進行長期擴增,并且在微衛星穩定(MSS)來源的CRC類器官中發現,類器官模型能夠保留樣本的遺傳多樣性和形態穩定性【9】。結直腸(癌)類器官的進一步優勢包括可以進行建庫、細胞異質性研究、實驗動物移植、個體患者分析和基因編輯,目前已經成為了疾病建模的優秀工具,未來可能在再生醫學領域大放異彩【10】

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圖3. 結直腸(癌)類器官在基礎和臨床研究中的應用【10】

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參考文獻

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【1】TORRE, Lindsey A., et al. Global cancer statistics, 2012. CA: a cancer journal for clinicians, 2015, 65.2: 87-108.

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【2】EVANS, Jonathan P., et al. From mice to men: Murine models of colorectal cancer for use in translational research. Critical reviews in oncology/hematology, 2016, 98: 94-105.

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【3】BROWN, Kai M., et al. Patient-derived xenograft models of colorectal cancer in pre-clinical research: a systematic review. Oncotarget, 2016, 7.40: 66212.

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【4】TOSHIMITSU, Kohta, et al. Organoid screening reveals epigenetic vulnerabilities in human colorectal cancer. Nature Chemical Biology, 2022, 18.6: 605-614.

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【5】BERGIN, Christopher J., et al. Protocol for serial organoid formation assay using primary colorectal cancer tissues to evaluate cancer stem cell activity. STAR protocols, 2022, 3.1: 101218.

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【6】FUMAGALLI, Arianna, et al. A surgical orthotopic organoid transplantation approach in mice to visualize and study colorectal cancer progression. Nature protocols, 2018, 13.2: 235-247.

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【7】VAN DE WETERING, Marc, et al. Prospective derivation of a living organoid biobank of colorectal cancer patients. Cell, 2015, 161.4: 933-945.

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【8】SASAKI, Nobuo, et al. Studying cellular heterogeneity and drug sensitivity in colorectal cancer using organoid technology. Current Opinion in Genetics & Development, 2018, 52: 117-122.

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【9】BEHJATI, Sam, et al. Genome sequencing of normal cells reveals developmental lineages and mutational processes. Nature, 2014, 513.7518: 422-425.

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【10】BARBáCHANO, Antonio, et al. Organoids and colorectal cancer. Cancers, 2021, 13.11: 2657.

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