環狀RNA(circRNA)藥物研究風生水起,RNase R不可或缺-null-資訊-生物在線

環狀RNA(circRNA)藥物研究風生水起,RNase R不可或缺

作者:蘇州近岸蛋白質科技股份有限公司 2022-04-29T15:38 (訪問量:6255)


日前,由北京大學魏文勝教授領銜的研究團隊,基于circRNA技術開發的新冠疫苗,在小鼠和恒河猴實驗中都誘導出了有效的免疫應答,并且能夠針對不同的新冠病毒變種包括德爾塔(Delta)和奧密克戎(Omicron)提供保護。該項研究在知名學術期刊《細胞》在線發表,可謂一石激起千層浪。 作為近幾年興起的突破性技術,mRNA疫苗通過脂質納米顆粒(LNP)將mRNA導入體內來表達抗原蛋白,以刺激機體產生特異性免疫反應。新冠肺炎疫情(COVID-19)爆發后,針對性的mRNA疫苗在多種疫苗類型中脫穎而出。與此同時,諸如自復制mRNA和circRNA等新型路線也逐漸走入大眾視野。 circRNA分子呈共價閉合環狀結構,不含5’-Cap和3’-polyA結構,不易被RNase降解,具有較高的穩定性。魏教授團隊采用了Group I核酶自催化策略來產生編碼SARS-CoV-2 RBD抗原的circRNA。該種方法是將核心序列插入到環化載體,生成用于體外轉錄(IVT)的模板,產生線性RNA后通過Group I核酶自催化形成circRNA。在RNA環化后需要用RNase R對未環化的RNA進行消化,來達到分離circRNA的目的。
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圖1:circRNA制備模板及環化后結構示意圖(本圖引自文章Circular RNA Vaccines against SARS-CoV-2 and Emerging Variants)

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RNase R來源于大腸桿菌RNR超家族,是一種鎂離子依賴性的3'—5'核糖核酸外切酶,可從3'—5'方向將RNA逐步切割成二核苷酸和三核苷酸。RNase R幾乎能夠消化所有線性的RNA,但不易消化環狀RNA、套索結構RNA和3'端突出少于7個核苷酸的短雙鏈RNA分子。通常用來消化線性RNA以富集circRNA或套索結構RNA。 近岸蛋白經過系列驗證,重磅推出高活性?RNase R(貨號:E224
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。 RNase R針對Total RNA、ssRNA及circRNA的消化實驗,實驗證明, RNase R可以消化絕大部分的總 RNA樣品,完全消化ssRNA樣品,對circRNA樣品起到良好的純化效果。

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為了進一步驗證RNase R對環狀RNA無酶切作用,利用qPCR方式檢測經RNase R(藍色:近岸蛋白;綠色:對照品牌)消化后的總RNA樣品中hsa_circKIF12a和hsa_circVapa基因的豐度變化,結果顯示,與陰性組(橙色)相同,兩個基因的豐度基本沒有變化,而經RNase A(粉色)消化的樣品中基因豐度明顯下降,表明環狀RNA耐受RNase R的消化。

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circRNA在生物和生物醫學領域的研究越來越熱,環狀RNA被證實具有多種分子機制,包括調控基因的轉錄和翻譯,調控蛋白質互作甚至可以被翻譯成小肽。不僅如此,環狀RNA還具有轉化醫學價值,它們在作為診斷性生物標志物或疾病治療靶點方面都具有應用潛力。在利用體外環化RNA技術制備針對免疫性疾病或癌癥的環狀RNA藥物方面,也逐步有企業加入進來,目前國內外已有數十家企業布局circRNA技術路線。相信隨著研發推進,circRNA技術會迎來新一波研究和產業化熱潮。

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貨號 產品名稱
E224 RNase R
E131 T7 High Yield RNA Transcription kit
GMP-E121 T7 RNA Polymerase, GMP Grade
GMP-E125 RNase Inhibitor, GMP Grade
GMP-M036 Pyrophosphatase, Inorganic (yeast), GMP Grade

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