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低dsRNA T7 RNA聚合酶突變體,助力降本增效

作者:蘇州近岸蛋白質(zhì)科技股份有限公司 2024-09-29T00:00 (訪問量:29186)

多年來,T7 RNAP已廣泛應(yīng)用于原核生物和真核生物中的高水平基因表達(dá),并在生物學(xué)其他領(lǐng)域的應(yīng)用得到廣泛擴(kuò)展,例如RNA干擾、RNA編輯、合成基因電路、構(gòu)建Vaccinia / T7混合系統(tǒng)等。

圖1: T7 RNAP 在生物領(lǐng)域的多方面作用[1]

雖然T7 RNAP得到了廣泛應(yīng)用,但是,其作為體外RNA合成工具也存在一些不可忽略的缺點(diǎn)。T7 RNAP在合成RNA的過程中可能會(huì)產(chǎn)生許多的副產(chǎn)物,包括轉(zhuǎn)錄起始過程中產(chǎn)生的寡核苷酸、終止信號(hào)造成的中斷RNA產(chǎn)物、依賴RNA的RNA聚合酶活性造成的3’末端延伸產(chǎn)物等。

因而,急需優(yōu)化改進(jìn)T7 RNAP,使其不僅能維持高效轉(zhuǎn)錄,同時(shí)也能夠減少RNA產(chǎn)物不均一的問題。現(xiàn)在專利主要集中在以下方面: 通過改變特定位點(diǎn)氨基酸,提高T7 RNAP突變體的熱穩(wěn)定性或轉(zhuǎn)錄活力;通過提高轉(zhuǎn)錄溫度,可以有效減少dsRNA的產(chǎn)生,但轉(zhuǎn)錄溫度的提高同時(shí),對(duì)生產(chǎn)工藝也提出了更高的要求;或通過定點(diǎn)突變T7 RNA聚合酶核苷酸序列增加酶的穩(wěn)定性等。

基于T7 RNAP突變體的研究還在不斷推陳出新。近岸蛋白推出新一代專利產(chǎn)品“T7 RNA聚合酶突變體”(專利號(hào):ZL 2021 1 0044261.3,產(chǎn)品目錄號(hào):GMP-E122),經(jīng)過上百個(gè)模板的驗(yàn)證,dsRNA產(chǎn)物在大多數(shù)模板上低于0.1ng/μg在修飾核苷模板上更是可以低于0.01ng/μg,相較于常規(guī)T7 RNA聚合酶,數(shù)量級(jí)降低dsRNA含量。

圖2:突變T7酶大幅降低dsRNA含量

在過往的突變體中,往往強(qiáng)調(diào)了某一方面的性能,卻伴隨著其他性能的減弱。近岸蛋白新一代T7 RNAP突變體除顯著降低dsRNA含量外,搭配特別優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液(產(chǎn)品目錄號(hào):GMP-EB001),從產(chǎn)量(1μg模板可獲得超過200μg RNA),到完整性(在不同質(zhì)量模板下,完整性均可提高5-10%)以及加帽率(95-100%)等均維持較高的水平,屬全能型選手

圖3:數(shù)據(jù)展示

同時(shí),隨著自復(fù)制mRNA的研究越來越熱,對(duì)于長片段轉(zhuǎn)錄的需求也越來越緊迫,傳統(tǒng)T7 RNAP在長片段轉(zhuǎn)錄方面存在不可忽視的欠缺(完整性差、dsRNA含量高等)。

近岸蛋白新一代T7 RNA聚合酶突變體在自復(fù)制模板上同樣展現(xiàn)出優(yōu)異的性能。

圖4:自復(fù)制saRNA完整性高

今年2月,Trilink帽結(jié)構(gòu)專利在國內(nèi)獲批,本來成本占比就比較高的前提下,加之專利授權(quán)費(fèi)用,雙重壓力下,無疑給mRNA藥物研發(fā)及生產(chǎn)企業(yè)帶來巨大的沖擊。那么此時(shí)減少帽結(jié)構(gòu)的用量無疑成為降低研發(fā)及生產(chǎn)成本的有效措施。為此,近岸蛋白特別設(shè)置從0.5mM-6mM帽結(jié)構(gòu)投入量,分別搭載常規(guī)T7 RNA聚合酶和新一代T7 RNAP突變體進(jìn)行轉(zhuǎn)錄反應(yīng),結(jié)果顯示,帽結(jié)構(gòu)使用量可以低至1mM,新一代T7 RNAP突變體在各個(gè)方面均表現(xiàn)出了優(yōu)異的性能。

 

經(jīng)過多種模板驗(yàn)證,近岸蛋白推出系列適合不同體系轉(zhuǎn)錄試劑盒,助力核酸藥物快速開發(fā):

貨號(hào) 品名 描述
E331 T7 High Yield RNA Co-Transcription Kit for Reducing dsRNA Content 低dsRNA共轉(zhuǎn)錄試劑盒(含N1-Me-pUTP修飾堿基)
E332 T7 High Yield RNA Transcription Kit 2.0 低dsRNA轉(zhuǎn)錄試劑盒
E334 T7 High Yield RNA Transcription Kit 2.0(N1-Me-pUTP) 低dsRNA轉(zhuǎn)錄試劑盒(含N1-Me-pUTP修飾堿基)
E341 T7 High Yield RNA Transcription Kit for Long Fragment 適合大于6K以上長片段轉(zhuǎn)錄試劑盒

 

更多相關(guān)產(chǎn)品

[1] Borkotoky Subhomoi,Murali Ayaluru,The highly efficient T7 RNA polymerase: A wonder macromolecule in biological realm.[J] .Int J Biol Macromol, 2018, 118: 49-56.

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