ATAC-seq是利用Tn5轉座酶切割染色質開放區域并標記DNA序列，結合二代測序來獲得相應基因信息。ATAC-seq技術的核心是孵育連接測序接頭的Tn5酶。Tn5酶對染色質開放區進行打斷，在打斷的同時加上測序接頭，接著進行DNA提取，PCR擴增構建文庫。經過測序，推斷染色質可及性、轉錄因子結合位點、組蛋白修飾區域和核小體位置。 近岸蛋白為助力表觀遺傳研究，革故鼎新，今年初成功升級ATAC-seq實驗方案2.0版本。
圖1. ATAC-seq實驗方案2.0流程示意圖
CUT&Tag技術作為一種新的DNA-蛋白質互作技術，與傳統的ChIP-seq技術有著根本不同，以其實驗周期短（＜10小時）、步驟簡單（無需超聲破碎和免疫共沉淀）、細胞起始量低（10萬以下，乃至單細胞）、重復性好、信噪比高等優勢，成為眾多研究人員的選擇。2019年近岸蛋白質推出CUT&Tag試劑盒，僅僅一個試劑盒就可以完成從靶蛋白結合DNA片段的獲取到測序文庫的構建。截止2024年8月底，CUT&Tag試劑盒引用文獻超過100篇，越來越多的研究表明，這是一個可以完全替代ChIP-seq的技術。
圖2.CUT&Tag與ChIP-Seq對比
對于表觀遺傳學的研究不能只局限于整個分子網絡中的某個局部細節，多維度、全方面研究表型調控機制才是大勢所趨。細數表觀遺傳相關高分文章不難發現，文章不僅僅包括ATAC-seq、RNA-seq、CUT & Tag、ChIP-seq這些常見表觀組學研究技術，更會涉及蛋白質組學、代謝組學、脂質組學、微生物組學等。
本文對ATAC-seq、CUT&Tag技術聯合組學的發表文章進行分類匯總（見下圖），掃描下方二維碼，即可獲取文獻包。（文獻包較大，建議電腦下載哦~）
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圖3 相關文獻整理
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