代謝物與腫瘤:乳酸依靠表觀遺傳操控癌干細胞命運和可塑性-技術前沿-資訊-生物在線

代謝物與腫瘤:乳酸依靠表觀遺傳操控癌干細胞命運和可塑性

作者:麥特繪譜生物科技(上海)有限公司 暫無發布時間 (訪問量:24039)

上皮組織靠干細胞自我更新維持功能,干細胞通路突變易致腫瘤。在腸道中,WNT(配體蛋白質Wnt和膜蛋白受體結合激發的一組多下游通道的信號轉導途徑)信號是干細胞狀態的關鍵開關(調節因子),要是這個 “開關” 被瘋狂按下(過度激活),就會推動腫瘤發生。結直腸腫瘤保留部分起源組織結構,存在“領導型的”癌干細胞(CSCs)和“下屬型”癌分化細胞(CDCs)。CSCs具有高WNT活性和強增殖能力,可分化為CDCs。CSCs在腫瘤生長中的作用明確,但CDCs的作用未知,其廣泛存在暗示對結直腸癌(CRC)進展有重要貢獻。CDCs去分化為CSCs的細胞可塑性在CSCs耗盡時被觀察到,可恢復腫瘤生長潛力。這些過程在體內和體外類器官中均存在,由腫瘤細胞協調,但其對治療耐藥性和復發的影響及調控機制尚未明確。此前研究發現腸細胞有獨特代謝表型,乳酸可在細胞間交換,但腫瘤細胞代謝表型及其對細胞命運的影響尚不清楚。

基于此,荷蘭烏得勒支大學醫學中心Maria J. Rodríguez Colman實驗室等在Cell Metabolism發表題為“Lactate controls cancer stemness and plasticity through epigenetic regulation”的研究文章,揭示乳酸依賴表觀遺傳調控因子MYC和BRD4,通過抑制分化和激活CDCs回歸CSC狀態,增加CSCs群體,表明乳酸是維持CSC群體和調控MYC影響腫瘤發展的關鍵因子。

研究思路圖

研究結果

1. CSCs和CDCs顯示出不同的乳酸代謝

先前研究發現,小鼠腸道干細胞和分化細胞存在代謝差異,人類結腸和結腸腫瘤中也存在類似代謝差異,免疫染色顯示分化細胞比干細胞表達更高水平的MCT4,提示其更具糖酵解性。腫瘤細胞中,CDCs的MCT4水平更高,表明腫瘤內細胞代謝存在差異。對60個腫瘤樣本進行單細胞RNA測序,結果發現腫瘤細胞存在干細胞樣、TA樣、腸上皮細胞樣和分泌細胞樣等類型,其中分化腸上皮細胞樣細胞糖酵解評分升高,TA樣細胞線粒體代謝評分最高。類器官模型顯示CSCs的NAD+/NADH比值高于CDCs,CDCs乳酸分泌更多,CSCs乳酸攝取能力更強,提示兩者存在代謝互作。這些結果表明,CSCs和CDCs在代謝上存在差異,CDCs的乳酸產生和CSCs的乳酸攝取可能在腫瘤發展中發揮重要作用。

圖1. CSCs和CDCs顯示出不同的乳酸代謝

2. 乳酸通過抑制分化和誘導去分化來增加CSC

腫瘤微環境的特征包括低葡萄糖和高乳酸,結果1已經表明,CDCs和CSCs通過乳酸相互作用。因此,作者進一步研究乳酸在腫瘤發展中的作用。

研究發現,高水平乳酸和低水平葡萄糖培養細胞,能顯著增加CSC群體,降低分化標志物表達,增加干細胞標志物表達,且在TPO3中更明顯。而單獨降低葡萄糖無法重現該表型;而抑制MCT轉運蛋白導致細胞內乳酸積累,也增加CSC數量,表明細胞外和內源性乳酸均促進CSC特性。

4D成像顯示,對照條件下,類器官中CSC比例隨時間減少;而乳酸條件下,細胞分化減少50%,去分化顯著增加。細胞的周期延長,類器官大小無顯著差異(乳酸增加了增殖性,CSC數量平衡了生長率)。在穩態下,腸道干細胞對稱分裂,乳酸使不對稱細胞命運頻率增至18.3%,主要是姐妹細胞去分化。這些結果表明,乳酸通過抑制分化、誘導CDCs回歸到增殖性CSC狀態來促進CSCs,揭示了乳酸水平升高在腫瘤發展中的重要作用。

圖2. 乳酸通過抑制分化和誘導去分化來增加CSC

3. 乳酸重塑代謝并獨立于線粒體丙酮酸轉運誘導干性

為了探究乳酸誘導干細胞特性的內在機制,作者研究分析了乳酸對代謝組的影響。結果發現,乳酸處理后,代謝組發生變化,糖酵解中間產物減少,TCA循環中間產物增加,丙酮酸和乙酰輔酶 A 水平顯著升高,表明乳酸可促進線粒體活性。

研究也發現,丙酮酸、DCA等處理可增加乙酰輔酶A水平和CSC數量,抑制細胞分化,增強去分化,誘導不對稱細胞命運,這些作用與乳酸類似。

此外,雖然線粒體活性對誘導癌癥干性很重要,但阻斷線粒體丙酮酸載體(MPC)并不能逆轉乳酸等誘導的CSC增加,說明乳酸可獨立于線粒體丙酮酸轉運支持線粒體呼吸和誘導干性。

綜上,乳酸通過驅動代謝重編程,增加線粒體呼吸作用和TCA循環中間體水平,從而誘導癌癥干細胞特性,且線粒體活性在這一過程中發揮關鍵作用。

圖3. 乳酸通過重編程代謝并誘導干細胞特性,且這一過程不依賴于線粒體丙酮酸的攝取

4. 乳酸增強了MYC位點的組蛋白乙?;腿旧|可及性

轉錄重編程在調控細胞類型特異性中起關鍵作用。對腫瘤類器官RNA測序分析顯示,乳酸處理后,差異顯著的基因主要富集于WNT信號通路、細胞增殖、遷移以及與染色質重塑相關等類別。

染色質重塑因子活性受底物和輔因子可用性調控。組蛋白乙?;治鲲@示,乳酸、丙酮酸和DCA處理增加了多個組蛋白殘基(H3pan、H3K27、H3K9)的乙?;?,且這種作用依賴于乙酰轉移酶活性。免疫熒光和FRET報告基因分析顯示,CSCs中的組蛋白乙?;礁哂贑DCs,抑制組蛋白乙?;傻窒樗岷虳CA增加CSC的作用。

ATAC分析表明,乳酸改變了652個基因的染色質可及性,其中90%的基因可及性增加,包括MYC等癌基因和WNT通路的轉錄因子。誘導MYC表達可模擬乳酸誘導的表型,表明乳酸對干性的調節依賴于對MYC表達的表觀遺傳調控

圖4. 乳酸增強了MYC位點的組蛋白乙?;腿旧|可及性

5. 乳酸誘導的干性和可塑性依賴于MYC

分析兩個RNA數據集(290和96個腫瘤樣本),發現MYC特征與糖酵解、氧化磷酸化正相關。單細胞水平上,MYC特征評分在不同細胞類型間有差異,TA樣細胞評分最高,CDCs糖酵解評分更高,且MYC與糖酵解特征無相關性。乳酸誘導的“MYC激活”狀態由糖酵解型CDCs等細胞創造的高乳酸環境支持,促進氧化型、增殖型CSCs發生。

乳酸對MYC及干細胞特性的影響受表觀遺傳調控。BRD4抑制劑可改變基因表達,抑制MYC及其特征基因,阻止乳酸和DCA增加CSC群體。4D活細胞成像顯示,BRD4抑制部分挽救乳酸誘導的分化抑制,顯著阻止去分化至CSC狀態,逆轉不對稱細胞分裂,阻止細胞周期延長。

使用MYC抑制劑和MYC敲低細胞系,發現二者均部分逆轉乳酸誘導的CSC增加和去分化,降低不對稱細胞命運頻率,減少克隆大小,延長細胞周期。誘導MYC表達對CSC增加有加成作用但不顯著。因此乳酸通過表觀遺傳調控影響腫瘤發展的關鍵方面,包括增殖、干細胞特性和癌細胞可塑性。

圖5. 乳酸誘導的干性和可塑性依賴于MYC

小結

通過人源腫瘤類器官及機器學習技術發現,乳酸作為代謝信號可維持癌干細胞(CSC)干性并驅動癌分化細胞(CDC)逆分化。機制上,乳酸通過誘導組蛋白修飾激活BRD4-MYC信號軸,以此增強CSC特性及腫瘤細胞可塑性。鑒于BRD4是該調控通路的核心節點,研發靶向BRD4的小分子藥物有望精準抑制CSC干性,為阻斷腫瘤復發提供新策略。

參考文獻

Lactate controls cancer stemness and plasticity through epigenetic regulation. Cell Metabolism. 2025

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