最強定量CP | 靶向代謝組學+Olink蛋白組學–雙組學驅動臨床疾病深層研究-技術前沿-資訊-生物在線

最強定量CP | 靶向代謝組學+Olink蛋白組學–雙組學驅動臨床疾病深層研究

作者:麥特繪譜生物科技(上海)有限公司 暫無發布時間 (訪問量:31295)

麥特繪譜多年來聚焦于全定量代謝組學技術,旨在給用戶帶來高穩定性、可重復性、可驗證性、可深度機制挖掘的高準確性定量方法,持續為用戶創造圍繞臨床痛點問題的功能研究價值。近年來,麥特繪譜持續加速拓展以代謝組學為核心的蛋白組等多組學服務,蛋白質組學作為后基因組時代生命科學研究的核心內容之一,蛋白組學的方法層出不窮,目前,蛋白質組學平臺除了最常用的液相色譜-串聯質譜(LC/MSMS)平臺,還包括蛋白芯片技術平臺、以及巧妙結合了PCR/NGS平臺的Olink定量蛋白組學技術,不同方法的原理和適用范圍不同。

今天向您隆重介紹定量代謝組學黃金搭檔——Olink蛋白組學技術,它與麥特繪譜經典的Q300/Q200/Q500等全定量代謝組學(每個代謝物都有一一對應的標準品及同位素內標)方法設計思路和理念高度一致,兩者均為高通量靶向定量方法,因而具有高度可重復性和可驗證性,是臨床診斷標志物和深度功能機制研究的又一法寶。

01. 什么是Olink蛋白組學?為什么要選擇Olink?

Olink蛋白組學技術是一種基于鄰位延伸分析(Proximity Extension Assay,PEA)技術的蛋白質檢測方法,技術的核心原理是使用一對與目標蛋白質特異性結合的抗體,每個抗體連接一個獨特的DNA序列。當這對抗體與目標蛋白結合時,它們的DNA單鏈可互補結合,并通過DNA聚合酶催化進行延伸成雙鏈DNA模板進行擴增,最終通過實時定量PCR(qPCR)或NGS技術檢測DNA信號,實現蛋白質的定量分析。因為針對每個待測蛋白都有一對特異性的抗體與之識別并結合,相較于常規的非靶向蛋白組學技術(如基于非標記定量技術Label-free、同位素標記相對和絕對定量技術iTRAQ及TMT、以及基于質譜數據非依賴型采集模式的DIA,Olink技術具有高特異性和高靈敏度。

2020年12月7日,Olink蛋白組與英國生物樣本庫(UK Biobank, UKB)(目前世界上最全面的生物醫學數據庫和研究資源之一)一起宣布,將聯合由十家頂級生物制藥公司組成的聯盟啟動全球最大的血液蛋白組研究之一:英國生物樣本庫制藥蛋白組學項目(UK Biobank Pharma Proteomics Project, UKB-PPP)。該項目由54,406人群參與,旨在對更深入的了解疾病過程并支持創新藥物的開發。

2021年7月13日,Olink Proteomics宣布,位于冰島的deCODE genetics將引進并在內部落地Olink® Explore 3072新一代蛋白質組平臺,借助Olink技術賦能NGS測序平臺,對其人群隊列樣本進行3072個蛋白質的高質量檢測分析,從而實現與既有基因組數據的多組學聯用。

02. Olink適合檢測哪些樣本?

Olink適用于來源于人或小鼠多種生物樣本,包括標準樣本:血清、血漿、腦脊液;非標樣本:尿液、組織、細胞和細胞培養上清、外泌體、唾液、痰液、灌洗液、鼻腔黏膜、骨髓、房水、皮膚、關節液、腹水、羊水等,因其目標明確定量準等優勢在生物、醫藥研究和臨床診斷研究中具有廣闊的應用前景。

03. Olink可靶向檢測哪些蛋白?

目前,Olink針對不同研究需求,可提供心血管、神經、腫瘤、腫瘤免疫、炎癥、發育、代謝、免疫應答、細胞調控、神經探索、心肌代謝、器官損傷等多個方向的48~5400 panel系列檢測,具體包括Target 48、Target 96、8個Target48組合而成的Target 384、以及其他N個Target48/96組合而成的panel,以及最新推出的HT5400等,其中 Target 48包含45/43個細胞因子相關蛋白生物標志物的檢測, Target 96包括92個蛋白生物標志物的檢測,不同的檢測panel針對特定的疾病或生物通路,研究者可以按照感興趣的應用進行panel search和匹配。

04. 與其他蛋白組學技術相比,Olink技術具有以下優勢

● 高靈敏度:能夠檢測到極低豐度的蛋白質(fg/mL級別),甚至可以檢測到單個細胞中的蛋白質。

● 高特異性:通過一對特異性抗體與目標蛋白質結合,具有較高的特異性。

● 高覆蓋性:所有檢測蛋白均為生物標志物,覆蓋100%信號通路。

● 高重復性:使用成熟的qPCR和NGS技術作為檢測手段,重復性好,數據質量高,適合大隊列大數據分析。

● 全自動化:自動化樣品處理流程提供了絕佳的簡易性、準確性和重復性。

● 超高通量:可以同時檢測成百上千種蛋白質,提供全面的蛋白質表達譜。

● 極低樣本量:僅需極少量的樣本(低至1µL)即可進行檢測,適用于珍貴的臨床樣本。

● 寬動態范圍:動態范圍橫跨近10個logs(fg–mg),覆蓋高、中、低豐度蛋白。

https://medicalxpress.com/news/2021-10-genes-diseases-proteins.html

與其他蛋白組技術相比,Olink蛋白組技術在靈敏度、特異性和通量方面具有優勢,特別適用于對微量樣本中的蛋白質進行精準定量和鑒定,尤其針對血液樣本,相比于質譜法,Olink技術可以高度特異性識別低豐度蛋白且無需進行富集或去高豐度蛋白處理。

05. Olink蛋白組學技術與代謝組學技術相結合,有望為疾病早期診斷的強大助力

Olink蛋白組學技術能夠以超高的靈敏度和特異性檢測大量蛋白質的變化,而代謝組學技術則專注于分析生物體內的代謝物,兩者結合可以從更多層面剖析臨床疾病狀態。

●在疾病早期,往往會先出現蛋白質和代謝物的細微變化,這些變化可能在常規檢測手段難以察覺時就被這兩種技術捕捉到。例如,在癌癥早期,通過對特定蛋白和相關代謝物的聯合監測,可以發現腫瘤細胞剛開始產生異常時的信號。

● 研究人員利用這兩種技術對大量臨床樣本進行深入分析,建立疾病早期的特征圖譜。通過對比健康樣本和處于疾病早期階段的樣本,精準定位具有指示意義的蛋白質和代謝物組合。

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