Omicron新變種BA.4和BA.5成美國流行株,會是突變最后版本嗎?-技術前沿-資訊-生物在線

Omicron新變種BA.4和BA.5成美國流行株,會是突變最后版本嗎?

作者:蘇州近岸蛋白質科技股份有限公司 2022-07-06T11:10 (訪問量:9491)

2021年9月,SARS-CoV-2 VOC突變株Omicron在南非發現,目前Omicron包括:BA.1、BA.2、BA.3、BA.4、BA.5 和后代譜系。此外,它還包括 BA.1/BA.2重組形式,例如 XE。根據美國疾控中心(CDC)近日發布的數據,Omicron新突變株BA.4和BA.5于4月首次由南非的科學家發現,截至到現在占據了美國新增病例的52.3%,超過了BA.2.12.1,成為美國流行突變株。

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圖1. 來源于CDC官網[1]

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Omicron突變株自從出現并迅速席卷全球,對疫苗和中和抗體的有效性提出了更大的挑戰。由于刺突蛋白的多個突變,包括其受體結合域 (RBD) 和 N端結構域 (NTD),Omicron BA.1 可導致嚴重的中和抗體逃避。隨后Omicron亞譜系BA.2在全球范圍內迅速崛起,超過了BA.1。與BA.1的RBD相比,BA.2包含三個額外的突變,分別為T376A、D405N和R408S,并且缺少BA.1所具有的G446S和G496S。BA.1上的S371L也被BA.2中的S371F替代。重要的是,新的Omicron變體仍在不斷涌現。最近出現的新Omicron變體包含與BA.2相同的RBD序列,但增加了L452和F486替換,即BA.2.12.1 (L452Q)、BA.2.13 (L452M)、BA.4 和BA.5 (L452R+F486V) [2]。

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圖2. SARS-CoV-2主要突變體發育樹以及BA.2, BA.2.12.1, BA.4, and BA.5重要突變[3]

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2022年6月17日,Yunlong Cao等人在《Nature》發表“BA.2.12.1, BA.4 and BA.5 escape antibodies elicited by Omicron infection”研究論文,研究團隊通過比較Spike 結構以及與受體ACE-2親和力,結果表明BA.2.12.1和BA.4/BA.5表現出與BA.2相當的ACE2結合親和力。但是,與BA.2相比,BA.2.12.1和BA.4/BA.5對來自3劑疫苗的血漿以及來自疫苗接種后BA.1感染的血漿表現出更強的中和逃逸能力??傊?,研究結果表明,Omicron可能會進化突變來逃避BA.1感染引起的體液免疫,這表明BA.1疫苗增強劑可能無法對新的Omicron變種實現廣譜保護[2]。

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圖3. Omicron各突變體的結構和受體結合特征[2]

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圖4. BA.2.12.1、BA.4和BA.5表現出比BA.2更強的抗體逃逸能力[2]

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2022年6月23日,發表在《Nature》上的一篇文章“What Omicron’s BA.4 and BA.5 variants mean for the pandemic”中寫道:“實驗室研究一致表明,疫苗免疫產生的中和抗體在阻斷BA.4和BA.5效果方面不如阻斷早期 Omicron菌株(包括BA.1和BA.2)有效??茖W家們說,這甚至可能使接種過疫苗和加強免疫的人容易受到多種Omicron感染。即使是因接種疫苗和先前感染Omicron BA.1而具有混合免疫力的人,也會產生難以使BA.4和BA.5喪失能力的抗體。研究小組將其歸因于變體的L452R和F486V尖峰突變[4]?!?/span>

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Omicron可能會繼續突變,新變體會在現有免疫系統中找到更多漏洞。東京大學的病毒學家 Kei Sato說:“沒有人能說BA.4/5是突變的終止版本。很有可能還會出現更多的Omicron變體?!痹絹碓蕉嗟目茖W家認為,包括Omicron和Alpha在內的變體可能起源于長達數月的慢性SARS-CoV-2感染,其中可以積累一系列免疫逃避和傳播增強突變。目前還不清楚下一個變體何時出現。BA.4和BA.5僅在BA.1和BA.2幾個月后開始在南非出現,現在這種模式正在英國和美國等地重復出現。但隨著全球對反復接種疫苗和感染的免疫力的增強,瑞士伯爾尼大學的計算流行病學家Althaus預測SARS-CoV-2流行的頻率會減慢[4]。

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Althaus還說,SARS-CoV-2的一個可能的未來是,它將變得像其他四種季節性冠狀病毒一樣,其水平隨著季節的變化而起伏,通常在冬季達到頂峰,并且通常每三年左右會再次感染人們?!白畲蟮膯栴}是癥狀是否會變得越來越溫和,以及長期COVID的問題是否會慢慢消失,”他說?!叭绻3脂F在這樣,那將是一個嚴重的公共衛生問題[4]?!?/span>

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近岸蛋白提供Omicron、BA.2、BA.2.12.1、BA.4、BA.5等多種突變株蛋白、假病毒和ACE-2過表達細胞株,可用于中和抗體/疫苗效價評估等。

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近岸蛋白提供Omicron及亞譜系突變蛋白:

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Cat. No.

Product Name

DRA214

Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.12.1, C-6His)

DRA205

Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.4&BA.5, C-6His)

DRA213

Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.4, C-6His)

DRA202

Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (Deltacron, BA.1×AY.4 recombinant, C-6His)

DRA198

Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-6His)

DRA199

Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-mFc)

DRA200

Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.2, C-6His)

DRA190

Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His)

DRA195

Biotinylated SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His-Avi)

DRA196

Recombinant SARS-CoV-2 S1 Protein (Omicron, B.1.1.529, C-10His)

DRA194

Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein V2 (Omicron, B.1.1.529, C-6His)

DRA197

Recombinant SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein (Omicron, B.1.1.529, N-6His)

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自2019年新冠疫情爆發以來,近岸蛋白研發上線SARS-CoV-2系列產品上百余種,包括ACE-2S-RBD、S-NTD、S-CTD、S-trimer、Nucleocapsid Protein、N-CTD、N-NTDNSP非結構蛋白、流行突變株蛋白、N和S抗體中和抗體、ACE-2過表達細胞株假病毒等,可用于新冠檢測試劑盒研發、中和抗體/疫苗效價評估、病毒侵染細胞研究等。

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SARS-CoV-2其他突變株蛋白:

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Alpha

(B.1.1.7)

Beta

(B.1.351)

Gamma

(P.1)

Delta

(B.1.617.2)

Lambda

(C.37)

Kappa

(B.1.617.1)

Epsilon

(B.1.429)

Eta B.1.5

Mu

(B.1.621)

C.1.2

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SARS-CoV-2假病毒和ACE-2過表達細胞株:

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Cat. No.

Product Name

XCV01

SARS-CoV-2 (D614G)-Luciferase 假病毒

XCV02

SARS-CoV-2 (D614G)-GFP 假病毒

XCV03

SARS-CoV-2 (D614G)-GFP-Luc 假病毒

XCV04

SARS-CoV-2 Alpha (B.1.1.7, D614G)-GFP-Luc 假病毒

XCV05

SARS-CoV-2 Beta (501Y.V2)-GFP-Luc 假病毒

XCV06

SARS-CoV-2 Gamma (P.1)-Luc 假病毒

XCV08

SARS-CoV-2 Delta (B.1.617.2)-Luc 假病毒

XCV07

SARS-CoV-2 Epsilon (B.1.429)-Luc 假病毒

XCV09

SARS-CoV-2 Lambda (C.37)-Luc 假病毒

XCV10

SARS-CoV-2 B.1.620-Luc 假病毒

XCV11

SARS-CoV-2 Kappa (B.1.617)-Luc 假病毒

XCV13

SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529)-Luc 假病毒

XCV15

SARS-CoV-2 Omicron (BA.2)-Luc 假病毒(可預定)

XCV16

SARS-CoV-2 Omicron (BA.4)-Luc 假病毒(可預定)

XCC14

293-ACE2 Overexpressed Cells

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N和S抗體:

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Cat. No.

Product Name

DA027

SARS-CoV-2 NP Antibody (Human IgG1,6G9)

DA080

SARS-CoV-2 NP Antibody (10D6)

DA081

SARS-CoV-2 NP Antibody (9E5)

DA078

SARS-CoV-2 NP Antibody (7G9)

DA079

2019-nCoV NP Antibody (10E3)

DA044

SARS-CoV-2 NP Antibody (Mouse IgG2a,9C2)

DA049

SARS-CoV-2 NP Antibody (4A6)

DA028

Anti-SARS-CoV-2 NP ScFv (4A6)

DA029

Anti-SARS-CoV-2 NP ScFv-Fc (Human IgG1,4A6)

NC025

Anti-SARS-CoV-2 S1 mAb (5D9)

DA041

Anti-SARS-CoV-2 S Antibody (5E8)

DA042

Anti-SARS-CoV-2 S Antibody (2B7)

DA033

Anti-SARS-CoV-2 NP mAb (IgG&IgM Positive Control)

DA032

Anti-SARS-CoV-2 Spike mAb (IgG&IgM Positive Control)

DA043

Anti-SARS-CoV-2 S-RBD Antibody (9B2)

DA034

Anti-SARS-CoV-2 S-hIgG1 Neutralizing Antibody (Human IgG1,8A5)

DA035

Anti-SARS-CoV-2 S-mIgG1 Neutralizing Antibody (Mouse IgG1,8A5)

DA036

Anti-SARS-CoV-2 S-cIgG1 Neutralizing Antibody (Cynomolgus IgG1,8A5)

DA039

Anti-SARS-CoV-2 S-IgM Neutralizing Antibody (Human IgM,8A5)

DA040

Anti-SARS-CoV-2 S-IgA Neutralizing Antibody (Human IgA,8A5)

NIM-RM5220

Neutralizing Antibody Solution Reference Material against receptor binding domain (RBD) of SARS-CoV-2

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參考文獻:

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1. CDC官網:CDC COVID Data Tracker: Variant Proportions

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2. Cao, Yunlong et al. “BA.2.12.1, BA.4 and BA.5 escape antibodies elicited by Omicron infection.” Nature, 10.1038/s41586-022-04980-y. 17 Jun. 2022, doi:10.1038/s41586-022-04980-y

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3. Wang, Q. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2022.05.26.493517 (2022).

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4. What Omicron’s BA.4 and BA.5 variants mean for the pandemic



蘇州近岸蛋白質科技股份有限公司,是一家專注于重組蛋白應用解決方案的高新技術企業,主營業務為靶點及細胞因子類蛋白、重組抗體、酶及試劑的研發、生產和銷售,并提供相關技術服務。公司定位為醫療健康與生命科學領域原料與技術解決方案的上游供應商,致力于為下游客戶提供及時、穩定、優質的產品及服務,助力全球生物醫藥企業和研究機構的技術與產品創新升級。

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