腸肝聯動新發現:NAD+信號如何‘串通’ILC2s,影響潰瘍性結腸炎-國內聚焦-資訊-生物在線

腸肝聯動新發現:NAD+信號如何‘串通’ILC2s,影響潰瘍性結腸炎

作者:麥特繪譜生物科技(上海)有限公司 暫無發布時間 (訪問量:34395)

炎癥性腸病(IBD),包括潰瘍性結腸炎(UC)和克羅恩病,是臨床上主要的慢性和復發性腸道炎癥疾病。在其他器官(如肝臟)存在異常的IBD患者中,往往存在IBD的嚴重程度增加,然而,肝臟疾病加重IBD的機制尚未完全了解。在哺乳動物中,肝臟通過色氨酸從頭合成煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+),并將煙酰胺(NAM)釋放到血液中,以供外周組織通過NAD+補救途徑來滿足NAD+的需求。越來越多的證據表明,NAD+代謝在編程腸道結腸炎期間的免疫反應中起作用,但尚不清楚主要循環自肝臟的NAD+是否通過調節腸道免疫細胞來影響結腸炎的組織修復。

近期,山東大學齊魯醫院消化內科李石洋教授、左秀麗教授和基礎醫學院袁得天教授Advanced Science發表了題為Sensing of liver-derived nicotinamide by intestinal group 2 innate lymphoid cells links liver cirrhosis and ulcerative colitis susceptibility的研究文章,通過代謝組學、單細胞轉錄組學、基因編輯和骨髓移植等技術手段,揭示了慢性肝病擾亂肝臟NAD+代謝,導致經肝-腸軸到達腸道的NAD+合成前體物NAM減少,損害腸道2型固有淋巴樣細胞(ILC2s)的組織修復功能,繼而在并發UC時加重疾病。(麥特繪譜提供13C6-Glucose代謝流檢測服務)

研究思路

圖1. 技術路線

研究結論

1. 肝損傷和潰瘍性結腸炎的癥狀相關

首先研究了肝損傷對結腸炎的影響,采用回顧性圖表分析了UC患者血清中丙氨酸轉氨酶(ALT)和天冬氨酸轉氨酶(AST)水平分類的潰瘍性結腸炎內鏡嚴重程度指數(UCEIS),發現肝損傷加重了UC患者的結腸炎癥狀,兩者呈現正相關關系,該結論在四氯化碳(CCL4)誘導和膽管結扎(BDL)肝損傷結合DSS實驗性結腸炎小鼠模型中得到驗證。

圖2. 肝損傷與UC和實驗性結腸炎的嚴重癥狀相關

2. 肝損傷損害人和小鼠NAD+代謝

進一步探索肝損傷加重結腸炎相關的機制,采用非靶向代謝組學對健康供體和肝硬化患者的血漿進行研究,發現有67種代謝物在肝硬化患者中減少,KEGG分析發現輔助因子的生物合成途徑變化最大,這是由L-絲氨酸、煙酰胺(NAM)、泛酸和視黃醇水平降低,以及脫氧膽酸3-葡糖醛酸和L-酪氨酸水平的增加造成的。對肝硬化患者血漿NAM進行檢測,發現健康人群的NAM水平顯著高于肝硬化患者。

RNA-seq數據顯示非酒精性脂肪性肝炎和酒精性肝炎患者肝臟樣本中,參與NAD+從頭合成和補救合成途徑的關鍵酶(TDO2、HAAO、QPRT)mRNA水平降低。在肝損傷小鼠模型中進行驗證,發現肝臟中Tdo2、Ido2Kmo的mRNA水平,以及肝臟NAD+、血漿NAM和腸道NAD+的水平均有所降低。

使用AAV2/8載體攜帶針對QPRT的mir30-shRNA(Qprt-KD),特異性敲低肝臟中的QPRT基因,成功降低了肝臟NAD+、血漿NAM和腸道NAD+的水平,在DSS誘導的結腸炎模型中,Qprt-KD小鼠表現出加重的疾病癥狀,而補充NMN(煙酰胺單核苷酸,NAD+前體)能夠逆轉這一趨勢,表明肝臟NAD+代謝對結腸炎進展有重要影響。

圖3. 肝損傷損害人和小鼠NAD+代謝

3肝損傷破壞腸道ILC2s

在分子層面繼續探索肝損傷加劇結腸炎的機制,采用單細胞轉錄組學對CCL4處理組小鼠進行研究,發現B/T/ILCs(固有淋巴細胞)減少。通過流式細胞術分析和小鼠模型實驗,確認CCl4處理減少了腸道ILC2s產生的效應分子Areg、IL-5和IL-13。將純化的腸道ILC2s回輸到CCl4處理的小鼠中,隨后進行DSS處理,發現恢復ILC2s功能能夠緩解CCl4加劇的DSS結腸炎。

圖4. 肝損傷破壞腸道ILC2s

4. 腸道ILC2s功能維持依賴于NAD+補救合成途徑

為了評估NAD+代謝是否直接調控ILC2s,使用不同的抑制劑來阻斷NAD+合成的不同步驟,GTN(NMNAT的抑制劑)顯著抑制了ILC2s的細胞活性和效應分子的產生,表明NAD+的生成對ILC2s的功能至關重要;FK866(NAMPT的抑制劑)顯著降低了ILC2s的存活率和細胞因子產生,進一步證明了NAD+補救合成途徑對ILC2s功能維持的重要性

圖5. 腸道ILC2s維持依賴于NAD+補救合成途徑

5. NAD+調節ILC2s的機制

NAD+作為電子受體,在糖酵解和三羧酸循環(TCA)中接受高能電子,最終將這些電子傳遞給電子傳遞鏈(ETC)的復合體I,驅動氧化磷酸化過程,這是細胞產生三磷酸腺苷的主要途徑。

ILC2s的SMART測序轉錄譜顯示NAD+合成抑制劑FK866處理后,大量基因表達發生變化,特別是細胞周期和氧化磷酸化途徑相關基因的下調。進一步的代謝組學分析顯示,IL-33激活ILC2s時,NAD+及TCA循環中間產物檸檬酸、異檸檬酸、琥珀酸等濃度增加,表明NAD+對TCA循環和氧化磷酸化的促進作用。

使用13C標記的葡萄糖追蹤ILC2s探究NAD+是否通過TCA循環代謝產物調控ILC2s,結果顯示FK866處理導致ILC2s中丙酮酸和蘋果酸積累,減少了琥珀酸及其13C標記的同位素體,以及NAD+和NADH的含量。補充TCA循環中間產物對NAD+和NADH水平無顯著影響,但琥珀酸能夠部分恢復FK866抑制的ILC2s功能,表明NAD+可以通過支持琥珀酸生成來維持ILC2s。

使用丙二酸單乙酯鉀鹽(EM-K+)阻斷琥珀酸向ETC的電子傳遞時,琥珀酸對FK866處理的ILC2s恢復作用被消除,進一步論證了NAD+通過支持TCA循環產生的琥珀酸維持ETC,從而保持ILC2s的正常功能

圖6. NAD+通過支持琥珀酸鹽維持腸道ILC2s

6. NAD+以細胞內在方式調節腸道ILC2s

從遺傳學的角度進一步探究NAD+對ILC2s的調控作用,利用基因編輯技術構建Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠模型,發現表達Areg、IL-5和IL-13的ILC2s數量均有所減少。從Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠中分離出ILC2s,并在體外培養系統中加入IL-2、IL-7、IL-25和IL-33等細胞因子,與野生型對照小鼠相比,Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠來源的ILC2s在數量、存活率以及效應分子產生方面均顯著降低。通過添加NMN或琥珀酸治療,可以恢復這些ILC2s的存活率和功能,支持了NAD+通過琥珀酸向電子傳遞鏈供電子以維持腸道ILC2s的存活和功能的機制。

通過混合骨髓移植實驗進一步證實了NAMPT在ILC2s中的內在作用,來自Nampt+/+Il5RFP-Cre(CD45.1/CD45.2)和Namptf/fIl5RFP-Cre(CD45.2/CD45.2)小鼠的骨髓細胞以1:1的比例混合,并轉移到Rag2–/–Il2rg–/–小鼠中。六周后,從嵌合小鼠的腸道中分離出ILC2s,并通過同系標記追蹤其來源。結果顯示,來源于Namptf/fIl5RFP-Cre骨髓的ILC2s數量以及產生Areg、IL-5和IL-13的ILC2s數量均較少。

給Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠和同窩對照組喂食DSS, Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠結腸炎更嚴重,結腸縮短,組織學嚴重程度增加,添加NMN后癥狀減輕,此外,NMN也使DSS處理的Namptf/fIl5RFP-Cre小鼠ILC2s數量以及Areg、IL5和IL-13得到恢復。

圖7. ILC2s 中NAMPT缺乏可加重DSS誘導的結腸炎

小結

本研究揭示了慢性肝病加重UC的免疫代謝調控機制,發現腸道ILC2s通過感知肝臟來源的NAM來調控UC癥狀,為治療伴有慢性肝病的UC患者提供新的免疫代謝靶點。

參考文獻

Sensing of Liver-Derived Nicotinamide by Intestinal Group 2 Innate Lymphoid Cells Links Liver Cirrhosis and Ulcerative Colitis Susceptibility. Advanced Science. 2024

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繪譜幫你測

本研究使用麥特繪譜提供的13C標記的葡萄糖代謝流檢測服務,發現NAD+可以通過支持琥珀酸生成來維持ILC2s的正常功能,揭示了NAD調控ILC2s的功能機制。麥特繪譜提供全面的代謝流檢測服務,可追蹤含13C和15N等被標記物100+種,全面覆蓋糖酵解和TCA循環通路、磷酸戊糖途徑、 氨基酸代謝、脂肪酸代謝、 一碳代謝、 核苷酸代謝通路等。豐富的個性化標記定制經驗–[U-13C6]-Fructose,[U-13C16]-Palmitate, [U-13C3]-Serine,[U-13C2]-Glycine, [U-13C3]-Alanine, [U-13C3]-Pyruvate, [U-13C4]Malic Acid, [U-13C18]-Oleic Acid, 13CO215N-NH4CL, [1, 2-13C2]-Glucose, [2,3,3-D3]-Serine, [2,3-13C2]Alanine, [1,2,3-13C3]-Choline等。歷經數年項目積累,檢測各類貼壁細胞、懸浮細胞、菌體、培養液、線粒體、組織、糞便等樣本類型,涵蓋多發性骨髓瘤、肝癌、線粒體遺傳代謝病、免疫細胞活性與疾病、心血管疾病等多個研究方向,合作項目成果突出,文章平均IF >10+。

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