2021年底，Omicron（B.1.1.529）突變體的出現對疫苗的有效性提出了很大的挑戰，Omicron Spike蛋白具有三十多個突變位點。最近，Omicron突變株的亞系BA.2.12、BA.4和BA.5，表現出更強的免疫逃避能力，并在全球范圍內傳播。然而，近來又有一種新出現的亞系BA.2.75在印度傳播很快，在印度最近報告的序列中占20%以上。與BA.2相比，BA.2.75在Spike有9個突變位點，其中N端結構域(NTD)有5個突變位點，分別為K147E、W152R、F157L、I210V和G257S，受體結合結構域(RBD)有4個突變位點，分別是D339H、G446S、N460K和R493Q。其中，BA.1出現G446S突變，BA.4/BA.5出現R493Q突變。在主流突變株中未觀察到N460K和D339H突變，其功能尚不清楚。BA.2.75較BA.2.38和BA.4/BA.5表現出顯著的局部增長優勢。
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圖1. Omicron突變亞系BA.1、BA.2、BA.4/5和BA.2.75上的Spike突變位點[1]
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Yunlong Cao等研究團隊發現BA.2.75比BA.2.12.1對接種后BA.2感染的血漿具有更強的中和作用，但比BA.4/BA.5更弱。然而，在接種后Delta感染的一小份血漿樣本中，BA.2.75似乎比BA.4/BA.5更具有更強的免疫逃逸作用，這可能可以解釋BA.2.75相對于BA.4/BA.5在印度的增長優勢。這種現象可能與Delta的R452刺激有關，它可以產生對BA.4/BA.5(也有R452)非常有效的強效抗體。與BA.2相比，REGN10933和COV2-2196由于R493Q的逆轉突變而部分恢復了對BA.2.75的中和作用。然而，它們對應的雞尾酒的療效沒有顯著改變，因為REGN10987和COV2-2130由于G446S突變而表現出降低的中和活性[2]。
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圖2. BA.2.38和BA.2.75引起的體液免疫逃避[2]
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為了研究BA.2.75的抗體逃逸機制，研究者測定了一組對BA.2有效的中和抗體，這些抗體來自D339H、N460K、R493Q和G446S可能影響的5個表位群。與BA.2相比，BA.2.75額外攜帶的4個RBD突變都可能導致中和逃逸，并且BA.2.75的抗體逃逸機制與BA.4/BA.5不同[2]。
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圖3. BA.2.75的抗體逃逸機制[2]
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通過表面等離子體共振(SPR)測定，BA.2.75的RBD比BA.2的RBD具有更高的hACE-2結合親和力，以及BA.2.12.1和BA.4/BA.5的RBD。根據深度突變掃描(deep mutational scanning, DMS)結果，應該歸因于R493Q和N460K突變，這種增強親和力的特性正在進一步研究和驗證[2]。
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圖4. BA.2和BA.2.75突變株RBD與ACE-2親和力驗證[2]
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近岸蛋白提供Omicron、BA.2、BA.2.12.1、BA.3、BA.4、BA.5以及BA.2.75等多種突變株蛋白、假病毒和ACE-2過表達細胞株，可用于中和抗體/疫苗效價評估等。
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部分數據展示：
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配體和受體結合
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Immobilized Human ACE-2-Fc(Cat#C05Y) at 5μg/ml (100 μl/well)can bind SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217).The ED50 of SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217)is 27.52 ng/ml.
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抗原和抗體結合
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Immobilized Anti-2019-nCoV S1 mAb (5D9) (Cat#NC025) at 5μg/ml (100 μl/well)can bind SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217).The ED50 of SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75)-His(Cat#DRA217)is 0.672 ug/ml.
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近岸蛋白提供Omicron及亞譜系突變蛋白：
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Cat. No. |
Product Name |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.75, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.3, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2.12.1, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.4&BA.5, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.4, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (Deltacron, BA.1×AY.4 recombinant, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (BA.2, C-mFc) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein (BA.2, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His) |
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Biotinylated SARS-CoV-2 S Protein RBD (Omicron, B.1.1.529, C-6His-Avi) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S1 Protein (Omicron, B.1.1.529, C-10His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 S-trimer Protein V2 (Omicron, B.1.1.529, C-6His) |
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Recombinant SARS-CoV-2 Nucleocapsid Protein (Omicron, B.1.1.529, N-6His) |
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參考文獻
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1. Evasion of neutralizing antibodies by Omicron sublineage BA.2.75. doi: https://doi.org/10.1101/2022.07.19.500716
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2. Neutralizing antibody evasion and receptor binding features of SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75. doi: https://doi.org/10.1101/2022.07.18.500332
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