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基因定點突變

作者:山東維真生物科技有限公司 2018-03-20T00:00 (訪問量:18512)

實驗原理

基因定點突變是指通過聚合酶鏈式反應(PCR)等方法改變目的基因的序列,包括堿基的插入、缺失、點突變等?;蚨c突變是基因研究中比較常用的方法,可以短時間內研究目的DNA所表達的目的蛋白的性狀及表征。

定點突變需要設計特定的突變引物。引物長度一般為25-45 bp,建議選擇30-35bp長度的引物p。引物至少要11-12bp才能與模板搭上,而這種突變PCR要求引物兩邊都能與模板搭上,所以引物的兩邊各設至少12bp。以要突變的位點堿基為中心,加上兩邊11-12 bp的序列。若兩邊引物太短了,很可能會造成突變實驗失敗。同時需要設計一條反向互補的引物。為保證PCR反應正常進行,引物設計完成后需計算Tm值,若Tm值不合適,可以適量調整引物長度。

實驗材料

PCR引物,質?;蛘呋蚪M模板,PCR BufferPCR用高保真酶,ddH2O。

實驗過程

1、PCR擴增

30 μL PCRphusion)體系如下:

成分

體積(ul

18.2

Buffer

6

DMSO

0.9

dNTP

0.6

0.3

引物F+R

1.5+1.501

DNA模板

?

?

2、膠回收

第一輪PCR產物需要進行膠回收后再進行二輪PCR

將第一輪PCR得到的條帶進行切膠回收后,作為模板進行二輪PCR,二輪PCR的引物已第一輪PCR所用的兩端引物。二輪PCR反應結束后需要進行純化回收,為下一步的酶切做準備。

?

3、酶切

通過酶切回收目的基因片段、載體時,避開基因中的酶切位點,選擇合適限制性內切酶。當酶切回收目的基因時要注意目的基因裝在PENTER載體的位置。用限制性內切酶處理目的載體時,要將載體片段的量控制在2μg以內,并在酶切反應后進行去磷酸化處理。

?

30μL酶切體系

成分

體積(ul

載體DNA

1-2ug

10X Buffer

1

E1

0.8

E2

0.8

補足30ul

?

4、連接

根據片段的大小以及基因的亮度來調節片段連接的比例,一般亞克隆的連接體系如下

成分

體積(ul

載體DNA

2

目的基因

6

T4連接酶

1

T4 Buffer

1


將連接產物放于22℃保持1~2h

?

5、轉化

1)冰上融化感受態DH5a,,加1ug/ul的質粒1ul10ul感受態中,冰上放置30min。

242℃水浴鍋中熱休克90s,迅速轉移至冰上2min-5mins。

3)超凈臺內向各管含質粒的感受態中加入500ul-1ml高壓過的LB培養基,37℃,低速培養1h。

4)取100ul轉化菌涂板,至菌液快干時,倒置于37℃恒溫孵箱中培養12-16小時,次日觀察菌落生長情況。

6、獲取正確質粒

1)挑取轉化子

挑去大腸桿菌轉化子至正確的抗性培養基中(KANA、AMP,并對HM號及孔號做好記錄。

2)酶切驗證

將提取好的質粒用合適的限制性內切酶進行酶切驗證。

10μL酶切驗證體系:

成分

體積(ul

質粒DNA

3

10X Buffer

1

E1

0.25

E2

0.25

5.5

?

37℃保持30min~1h后進行瓊脂糖凝膠電泳。

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