小鼠、血液、植物多樣本直擴PCR-商家動態-資訊-生物在線

小鼠、血液、植物多樣本直擴PCR

作者:上海魔兜兒生物科技有限公司 2025-05-27T00:00 (訪問量:29183)

PCR-based Genotyping等實驗,常需純化樣本基因組。當待測樣本較多時,純化基因組的過程費時、操作重復,并且實驗成本高。 

直擴PCR直接從樣本開始,以未經基因組純化的微量原始樣本或其裂解產物作為模板,進行PCR-based Genotyping。與常規PCR-based Genotyping相比,直擴樣本用量少,操作簡單,實驗成本低,可高通量化樣本檢測。

圖. Direct PCR技術

A. 直接法:取少量樣本直接加入到PCR Master Mix中,進行PCR鑒定。

B. 裂解法:樣本取樣后,加入裂解液中,裂解釋放基因組,取少量裂解上清液加入到PCR Master Mix中,進行PCR鑒定。

 

技術優勢   

♦ 直接:無需進行費時而昂貴的DNA純化

♦ 快速:10min完成模板制備,最少50min完成PCR反應

♦ 簡便:樣品無需剪碎或研磨即可完成裂解;PCR Mix為預混液形式,減少加樣步驟

♦ 節省:材料用量少

♦ 高通量:可在96孔板中完成裂解反應

 

直擴PCR試劑盒類型

產品參數

小鼠組織直擴試劑盒

血液直擴試劑盒

植物組織直擴試劑盒

適用生物

小鼠、大鼠

廣泛生物

水稻、玉米、煙草、油菜、小麥、大豆等

適用組織/材料類型

鼠尾、鼠耳、腳趾(帶肌肉)和其他臟器

含常規抗凝劑的新鮮血液、冷藏(凍)血液及Whatman903®和FTA®商用干血漬

嫩葉、老葉、幼苗、嫩莖

樣品使用量

組織:5-10mg,鼠尾:1-5mm

最佳全血模板體積濃度范圍為0.5%-20%,推薦使用量為10%作為初始嘗試條件。對于貯存在Whatman®濾紙卡上的干血漬,則可取約1 mm2帶血漬的圓紙片

葉片:1-10mm,種子:1-3mm

基因組釋放時間

15min

無需

0-10min

PCR產物最適長度

<1kb

PCR產物是否加A

是,但裂解反應體系加A效率不定

20µL體系,裂解產物使用量

0.2-2µL

無需裂解

0.2-1µL

應用

轉基因鑒定、基因分型等

 

實驗過程 

本系列產品運用獨特的蛋白酶裂解體系,裂解樣品,裂解液可直接作為模板,搭配試劑盒中的PCR Master Mix進行基因擴增。

圖. 小鼠組織直擴PCR實驗過程

  

圖. 植物組織直擴PCR實驗過程

 產品性能

1、基因敲除小鼠基因型鑒定

圖. 小鼠直擴PCR試劑盒檢測基因敲除直擴結果

M:100bp DNA ladder。1-8以裂解產物為模板。+以50ng純化基因組DNA為模板。﹣:以去離子水為模板。循環數:35個循環。

單條帶(580bp):敲除動物純合子基因組。單條帶(180bp):野生型基因組。兩條帶(580bp/180bp):敲除動物雜合子基因組。

2、小鼠基因釋放更快速、更充分

圖. 小鼠組織直擴PCR試劑盒不同裂解時間直擴結果

M:100bp DNA ladder。+以50 ng純化基因組DNA為模板。循環數:35個循環。

圖. 鼠尾經不同裂解方式處理后的直擴結果。

檢測基因:SOX21。M:100 bp DNA ladder。1-2以常規堿裂解方式處理裂解產物為模板。

3-4以小鼠組織直擴PCR試劑盒裂解產物為模板。+以50 ng純化基因組DNA為模板。﹣:以去離子水為模板。循環數:35個循環。 

3、小鼠直擴表現優于競品

圖. 鼠尾經不同品牌同類產品裂解處理后的直擴結果

檢測基因:SOX21。M :100 bp DNA ladder。以50 ng純化基因組DNA為模板。循環數:35個循環。


4、多類型植物樣本驗證表現優異

圖. 不同類型植物葉片直擴結果

M:100 bp DNA ladder。C相應植物純化基因組DNA為模板。1-2葉片組織裂解產物為模板。循環數:30個循環。

 

5、多類型血液樣本驗證表現優異

圖. 使用Positive control primer mix引物直接從不同物種、不同抗凝劑的全血及血卡中擴增237 bp的DNA片段。

血液模板濃度為10%,血卡模板為1 mm2大小。NTC為DEPC水作為模板,PC為提取純化的人基因組DNA作為模板。1.人EDTA抗疑血(-20°C);2.小鼠EDTA抗凝血(新鮮);3.山羊EDTA抗凝血(-80℃);4.人血卡;5.人肝素抗疑血(-80°C);6.雞肝素抗凝血(新鮮);7.豬檸檬酸鈉抗疑血(4°C);8.NTC ;9.PC。

6、血液樣本耐受性最高可達40%

圖 含肝血抗凝血人血液直擴2kb、71%GC目的片段結果

血液模板濃度設置0.5-50%,延伸時間10 s/kb。

圖 含EDTA抗凝血小鼠血液直擴2.2kb、67%GC目的片段結果

血液模板濃度設置0.5-50%,延伸時間10 s/kb。

 

客戶反饋
1、北京客戶:小鼠基因型鑒定效果優異

圖. 使用Arcegen小鼠直擴PCR試劑盒進行小鼠基因型鑒定結果 

2、武漢客戶:水稻基因直擴效果優異

圖. 使用Arcegen植物直擴PCR試劑盒擴增水稻相關基因

3、上??蛻簦貉褐睌UPCR在競品中表現優異。

圖 使用Arcegen血液直擴PCR直接從人全血擴增不同長度DNA片段

血樣為-20℃儲存的EDTA抗凝血,血液模板濃度為10%,延伸時間10 s/kb。

237 bp;2. 150 bp (30%GC);3. 120 bp (75%GC);4. 2.1 kb (30%GC);5. 2 kb (71%GC);6. 4 kb (68%GC);7. 5 kb (65% GC);8. 8 kb (48% GC)

 

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產品應用

產品名稱

貨號

規格

目錄價

直擴PCR,支持5重擴增,高GC兼容

Mouse Tissue Direct PCR Kit (With Dye)
小鼠組織直擴PCR試劑盒(含染料)

N132021E

50 T

300.00

N132021S

200 T

900.00

Blood Direct PCR Kit (With Dye)
血液直擴PCR試劑盒(含染料)

N132022E

20 T

200.00

N132022S

100 T

700.00

Plant Tissue Direct PCR Kit (With Dye)
植物直擴PCR試劑盒(含染料)

N132023E

50 T

400.00

N132023S

200 T

1200.00

裂解液組分

Mouse Tissue/ Cell Lysis Reagent
小鼠組織/細胞裂解液

N132028E

50 T

125.00

N132028S

200 T

300.00

 

 

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產品名稱

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1200.00

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Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water)
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N132109S

500 μL

580.00


背景干凈、帶型穩定、大小精準;
含上樣緩沖液,含5×loading buffer,可直接電泳,方便快捷;
極佳穩定性,室溫6個月,-20℃1年。

1000bp DNA Ladder, 250-12000bp

N132116S

100 T

110.00

N132116M

10×100 T

990.00

50bp DNA Ladder, 50-1000bp

N132111S

100 T

110.00

N1321112M

10×100 T

990.00

100bp DNA Ladder, 100-1500bp

N132112S

100 T

110.00

N132112M

10× 100 T

990.00

100bp plus DNA Ladder, 100-3000bp

N132113S

100 T

110.00

N132113M

10×100 T

990.00

200bp DNA Ladder, 200-5000bp

N132114S

100 T

110.00

N132114M

10×100 T

990.00

500bp DNA Ladder, 500-5000bp

N132115S

100 T

110.00

N132115M

10×100 T

990.00

2000bp DNA Marker, 100-2000bp

N132117S

100 T

110.00

N132117M

10× 100 T

990.00

5000bp DNA Marker, 100-5000bp

N132118S

100 T

110.00

N132118M

10× 100 T

990.00

10000bp DNA Marker, 100-10000bp

N132119S

100 T

110.00

N132119M

10×100 T

990.00

12000bp DNA Marker, 100-12000bp

N132120S

1 mL

110.00

N132120M

100x1 mL

20900.00

15000bp DNA Marker, 250-15000bp

N132121S

100 T

110.00

N132121M

10× 100 T

990.00

 

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