1.題目： 一種用于發現針對多重耐藥細菌抗菌肽的生成式人工智能方法
A generative artificial intelligence approach for the discovery of antimicrobial peptides against multidrug-resistant bacteria
DOI：10.1038/s41564-025-02114-4
發表時間：2025-10-3
發表期刊：Nature Microbiology
影響因子：19.4
作者單位: 山東大學
文章摘要：
針對臨床超級細菌的新型抗菌肽（AMPs）的發現迫切需要，以應對持續的抗生素耐藥性危機?？咕囊蚱鋸V譜活性、快速殺菌機制以及相比傳統抗生素更低的耐藥誘導可能性，是有前景的候選藥物。這篇文章，建立了一個預訓練的蛋白質大型語言模型（LLM）ProteoGPT，并進一步發展為多個專門的子大型語言模型，以構建順序流水線。該管線實現了對數億肽序列的快速篩選，確保了強效的抗菌活性并最大限度地降低細胞毒性風險。通過遷移學習，我們賦予LLM不同的領域特定知識，實現在統一方法論框架內高通量的AMP挖掘和生成。值得注意的是，開采和生成的抗菌肽在體外對ICU來源的耐碳青霉烯不動桿菌（CRAB）和耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）的耐藥性降低。AMPs在體內大腿感染小鼠模型中也顯示出與臨床抗生素相當或更優的治療效果，且未造成器官損傷或破壞腸道微生物群。這些抗菌素的作用機制涉及細胞質膜的破壞和膜去極化?？傮w而言，本研究提出了一種生成式人工智能方法，用于發現針對多重耐藥細菌的新型抗菌藥物，從而實現對抗菌空間的高效和廣泛探索。
部分結果展示：
 
圖4：體外抗菌肽抗菌療效及生物學特性評估。
a， 抑制區直徑中對大腸桿菌和金黃色葡萄球菌具有抑制作用的抗菌肽比例。
中喬新舟生物的產品DMEM高糖基礎培養基（貨號：ZQ-100 ）和青霉素- 鏈霉素混合溶液（雙抗）（貨號：CSP006）參與了該項研究。
 
2. 題目： 中風后神經前體細胞移植和血管形成的注射式微孔形成微凝膠支架
Injectable micropore-forming microgel scaffold for neural progenitor cells transplantation and vascularization after stroke
DOI：DOI: 10.1038/s41467-025-64240-1
發表時間：2025-10-23
發表期刊：Nature Communications
影響因子：15.7
作者單位: 上海交通大學
文章摘要：
中風干細胞治療受限于細胞存活率差和在缺血微環境中的整合性。注射微膠因其促進細胞浸潤的能力被廣泛應用于細胞遞送，但密集的水凝膠網絡常常限制細胞存活。這篇介紹一種可注射的微凝膠-基質復合支架，結合了用于神經前驅細胞（NPCs）遞送的微孔微凝膠與間質空間以支持血管生長。采用氣體剪切制備方法，初級大鼠NPC被高效包裹在相分離微孔微凝膠（PSMM）中，展現出優越的生存率和增殖率。體外研究表明，PSMM支架支持內皮細胞（EC）的萌發和血管形成，在缺血性卒中大鼠中，這種支架顯著提升了NPC負荷能力、存活率和分化率，同時增加了EC的增殖和浸潤。最終，微凝膠基質支架增強了中風模型中的神經長期恢復，提供了一種高效策略，將高細胞負荷與血管形成相結合，推動再生醫學的發展。
部分結果展示：
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圖3：微凝膠支架的間隙空間和注射性，促進體外胚胎血管形成。
I 嵌入微膠中的ECS/MSC三維發芽測定。代表性熒光顯微照片顯示第3天嵌入細胞的CD31（綠色）和F-肌動蛋白（紅色）。以及相應的血管化面積和血管長度定量結果。J 微凝膠中培養的ECS和HEF血管生成實驗。代表性熒光顯微照片顯示第7天的ECSCD31（綠色）和F-肌動蛋白（紅色），并有血管化面積和血管長度的定量結果。
中喬新舟生物的細胞產品原代人骨髓間充質干細胞HMSC-bm（貨號：PRI-H-00137）和原代人臍靜脈內皮細胞-huvec（貨號：DFSC-EC-01/PRI-H-00023）參與了該項研究。
 
 
3. 題目：內皮BMP6驅動頸動脈粥樣硬化中血流動動力學依賴的VSMC鈣化
Endothelial BMP6 Drives Hemodynamic-Dependent VSMCs Calcification in Carotid Atherosclerosis
DOI：10.1002/advs.202502801
發表時間：2025-10-13
發表期刊：Advanced Science
影響因子： 14.1
作者單位: 鄭州大學
文章摘要：
頸動脈粥樣硬化（CAS）是缺血性卒中的主要原因，血管鈣化推動疾病進展。然而，驅動CAS血管鈣化的分子機制尚未明朗。先前的研究證實，骨形態發生蛋白（BMPs）在鈣化中起著關鍵作用;然而，BMP6信號在血管鈣化中的調控機制尚不明確。本研究旨在探討BMP6在CAS血管鈣化中的作用及其潛在機制。通過對人類CAS斑塊進行單細胞RNA測序，發現了一組BMP6表達較高、通過BMP信號通路與特定血管平滑肌細胞（VSMC）相互作用的內皮細胞（ECS）。體外實驗證明了BMP6誘導的VSMCs骨發生性分化。此外，BMP6通過結合BMP6受體復合體，激活SMAD信號通路。內皮特異性BMP6敲除（BMP6^?？?/sup>ApoE^−/−）和過度表達小鼠證實BMP6加重血管鈣化，而其敲低作用減少鈣化病變。此外，流動受擾通過抑制Krüppel樣因子4，并將血流動動力學力量與BMP6介導的鈣化聯系起來，上調BMP6表達。這些發現表明，BMP6是CAS血管鈣化的關鍵調控因子，由EC–VSMC相互作用和血流動動力學應激驅動。
部分結果展示：
 
圖4 EC來源的BMP6促進VSMCs的骨質分化。
A）HAoSMCs和HUVEC共培養系統的示意圖。下腔室的HUVECs在24小時前用BMP6過表達質?；蚩蛰d體對照（OE-NC）質粒轉染，并與上腔的HAoSMCs共培養48小時，使用六孔跨孔單元。
 
圖9.流動受阻通過上調的KL4轉錄因子啟動BMP6表達。
D）對與含si-NC（負對照小干擾RNA[siRNA]）和si-KLF4轉染的HUVEC共培養的HAoSMCs中KLF4、BMP6、MSX2、RUNX2、Osterix、p-SMAD1/5/8和SMAD1的蛋白質表達水平進行了Western blot分析。GAPDH被用作裝載控制（虛線框）。蛋白質表達水平的定量數據見右側（n = 6）。E）在與用si-KLF4轉染的HUVECs共培養并可與LDN-214117處理的HAoSMCs中，進行MSX2、RUNX2、p-SMAD1/5/8和SMAD1的Western blot.
中喬新舟生物的細胞產品原代人臍靜脈內皮細胞-huvec（貨號：DFSC-EC-01/PRI-H-00023）參與了該項研究。
 
4. 題目：去甲腎上腺素通過受體脫敏誘導Sertoli細胞鐵剝落，導致壓力相關的男性生殖功能障礙
Norepinephrine Induces Sertoli Cell Ferroptosis via Receptors Desensitization Causing Stress-Related Male Reproductive Dysfunction
DOI：10.1002/advs.202504817
發表時間： 2025-10-06 
發表期刊：Advanced Science
影響因子：14.1
作者單位: 西安交通大學
文章摘要：
心理壓力對男性生殖構成重大威脅；然而，其底層的分子機制仍然了解不清楚。應激誘導的交感神經系統過度激活會觸發去甲腎上腺素（NE）的分泌，這是一種參與多種病理生理過程的關鍵介質。盡管NE與男性生殖功能障礙有關，但具體機制尚不清楚。本研究證明，心理壓力可通過NE誘發Sertoli細胞鐵剝亡，其特征包括鐵過載、脂質過氧化以及鐵相關蛋白表達改變。普萘洛爾阻斷β腎上腺素能受體（β-ARs）緩解了壓力引起的損傷，抑制鐵凋亡并促進精子生成。體外選擇性β₁- 還有β₂-AR拮抗劑逆轉了NE誘導的Sertoli細胞鐵剝蝕。機制上，NE激活β-抑制素1，驅動β-AR的脫敏和內化，進而刺激抑制性G蛋白（Gi），抑制CREB1依賴的GPX4轉錄，并促進鐵剝落。研究結果表明，NE誘導的β-ARs脫敏是Sertoli細胞鐵剝壞的機制驅動因素。β-ARs信號調制被提出作為緩解壓力相關男性生殖障礙的潛在治療方法。
部分結果展示：
 
圖3.NE會誘導TM4細胞中的鐵剝細胞。
A） 對用NE或DMSO處理的TM4細胞進行實驗性分組。
 
圖4. Fer-1能拯救TM4細胞中NE誘導的鐵凋亡。
A） TM4細胞對NE處理，無論是否使用Fer-1（0.5微米）。
 
圖5. 抑制β-ARs可挽救NE誘導的鐵剝亡。
A） TM4細胞用NE、阿替洛爾（ATN，β處理1-AR特異性，1微米），或ICI118551（ICI，β2-AR特異性，1微米）。K） 對每個處理組TM4細胞裂解液中的ACSL4、SLC7A11和GPX4表達進行Wb 分析（n = 3–4）。數據以SEM均值±呈現。
中喬新舟生物的細胞產品TM4小鼠睪丸支持細胞（貨號：ZQ0091）參與了該項研究。
 
5. 題目：NIR-II響應性多功能支架，實現“殺傷-調制-構建”協同治療感染性骨缺損
NIR-II Responsive Multifunctional Scaffold Enabling “Kill-Modulation-Build” Synergistic Therapy for Infectious Bone Defects
DOI：10.1002/advs.202508948 
發表時間：2025-10-07 
發表期刊：Advanced Science
影響因子： 14.1
作者單位: 南京醫科大學
文章摘要：
感染性骨缺損面臨雙重挑戰：消滅細菌和組織再生，而這些問題還因生物膜形成、抗生素耐藥性和慢性炎癥而更加復雜。這里開發了近紅外II（NIR-II）響應型纖維支架，采用順序“殺傷-調節-構建”治療策略，涵蓋感染清除、免疫調節和骨骼修復。在NIR-II照射下，聚集誘導的發射納米顆粒（AIE NPs）產生局部高熱反應，消除細菌和生物膜，提供一種非抗生素解決方案，降低耐藥性發展風險。此外，黑磷納米片（BP NSs）會清除活性氧（ROS），并將巨噬細胞重新編程為促進再生的M2表型。這種免疫調節轉變促進骨髓干細胞的內皮遷移、新生血管形成和骨生成分化。憑借優異的生物相容性和仿生結構，支架支持協調的抗菌、免疫調節和骨誘導反應。這項工作為結合光熱療法與免疫和再生調節，為復雜感染性骨缺陷的治療提供了有前景的平臺。
部分結果展示：
 
圖4. AIE NPs@BP NSs@FSs的生物相容性和抗菌特性。
中喬新舟生物的細胞產品原代人口腔角質形成細胞（貨號：PRI-H-00140）參與了該項研究。